科学家绘制小细胞肺癌蛋白基因组学图谱
肺癌是全球癌症致死的首位原因,而小细胞肺癌约占肺癌总数的15%,是所有肺癌亚型中恶性程度最高、预后最差的亚型,5年生存率仅为5%。与非小细胞肺癌形成鲜明对比,小细胞肺癌的治疗手段单一,患者总生存率低。分子表征与组学研究不足,限制了小细胞肺癌的基础研究和临床进展,迄今为止,仅有少量针对小细胞肺癌临床样本的基因组研究被报道。小细胞肺癌普遍存在TP53和RB1的失活突变。缺乏驱动突变使得研究难以通过基因突变信息获得有效靶点和分子分型。蛋白质作为生命功能的执行者,是95%以上药物的作用靶点。目前,缺乏从蛋白质组层面对小细胞肺癌的系统研究,因此全面系统地表征小细胞肺癌的蛋白质组学图谱,利于剖析小细胞肺癌的病理机制,对于实现更精准的小细胞肺癌分子分型和个性化治疗具有重要意义。1月5日,《细胞》(Cell)在线发表了中国科学院上海药物研究所研究员周虎团队,与同济大学附属上海市肺科医院教授张鹏团队、中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员季红斌......阅读全文
血液检测帮助肺癌病人快速选择最佳治疗方法
2016年10月19日讯 /生物谷BIOON/ --最近一项研究表明基于血液样本进行的基因组和蛋白组学检测对于肺癌病人的诊断有重要作用。 非小细胞肺癌是一类有共同特性但是存在不同基因特征的肺癌类型,基因特征的不同让病人对一些特定治疗方法的应答情况也出现不同。在这项研究中,研究人员证实对血液样本
2011国际基因组学大会在长春召开
10月23日,由中科院、吉林省政府主办的2011国际基因组学大会暨中国北方药用物种基因组学转化研究中心成立仪式在吉林省长春市举行。海内外200多名知名专家学者出席大会。 与会专家学者围绕“基因组学时代的机遇与挑战”主题,从“基因组科学”“基因组技术”“基因组信息学与计算生物学”,及“基因组
家犬基因组学研究获新进展
科学界对于家犬的起源和驯化一直争议不断。近日,中科院院士张亚平带领团队发现,家犬中亚起源的假说与基于全基因组重测序数据分析的家犬东亚南部起源模式相冲突。相关成果日前在线发表于美国《国家科学院院刊》。 2015年,美国学者Shannon等人通过分析大量的家犬群体全基因组DNA芯片数据,提出了家犬
安捷伦科技发布基因组学站式网站
2010年4月19日,北京 – 安捷伦科技公司(NYSE:A)日前发布了一个全新的的动态基因组学网站,genomics.agilent.com。 此网站将是所有基因组学资源的一站式供应点。用户可在其中找到众多组织有序、易于查找的信息,从最新的科学进展到最热门的产品一应俱全。此网站以一体化网
杂交稻基因组学研究获进展
中科院上海生科院植物生理生态研究所韩斌院士课题组联合中国水稻所杨仕华等团队,在杂交稻基因组学及杂种优势遗传机制研究中获重要进展,2月5日,相关成果在线发表于《自然—通讯》杂志。 据介绍,杂交水稻育种技术的成功是我国近几十年来取得的一项重要科技成就。伴随着汕优63、两优培九等一大批高产杂交稻品种
基因组学将如何进入日常医学?
随着大规模的DNA结果越来越多的可供病人和保健提供者使用,医学界在酝酿着一次平静的转换。在一连串的数据当中,医生、顾问和家庭正在梳理如何更好地理解这些信息,并将其用于医疗决策的制定。 最近,在两大儿科医院举行的临床遗传学会议上,来自多家机构的专家提出了他们对于“基因组整合到临床实践”的第一份建
英国基因组学研究进展迅速
随着基因数据的逐渐增多,临床医生能够更好地治疗患者,同时减少医疗事故的发生。英国国家医疗服务体系(National Health Service,NHS)中的许多遗传学中心现在都在使用芯片和外显子测序。 近日,英国卫生大臣Jeremy Hunt和生命科学部长George Freeman将宣布新
协同创新驱动农业基因组学发展
“作为生物技术领域最基础的学科,农业基因组学研究不仅需要国内外科学家同行的协同创新,更需要与生物技术产业发展需求无缝衔接,才能发挥出农业基因组学的最大潜能。基于这种认识,在国家农业科技创新联盟的框架下,建立农业基因组学的协同创新联盟就显得十分迫切。”中国农科院科技局局长梅旭荣表示。 7月24
解决基因组学重要挑战的新工具
单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术,可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多,但是,仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列,从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前,去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列,还是一个手动和耗时的过程,为了去除污染
基因组学推动生命科学大步向前
2010年下旬,河南安阳曹操墓真伪之辩正酣。而一则来自上海的重磅消息更是引发了多方关注。复旦大学现代人类学教育部重点实验室宣布,向全国征集曹姓男性DNA样本,拟用基因组科学的手段验证出土的头骨是否为曹操本人。 一下子,基因组科学成为热门,这一话题“落入寻常百姓家”。 事实上,伴随着2
Nature发布比较基因组学研究重要发现
来自杜克大学医学院、Brigham妇女医院和哈佛医学院的研究人员,发现了一个机制可以解释:一些遗传突变在一种基因组中会致病,而在另一种基因组中则为良性的原因。 在发表于6月29日《自然》(Nature)杂志上的研究论文中,研究人员比较了成千上万的人类致病突变与大约100个动物物种的相似序列。
美国推动基因组学转向临床医学
美国政府将用数亿美元积极推动基因组学向临床医学的转化,探索基因组学的新前沿。12月6日,国立卫生研究院(NIH)所属国家人类基因组研究所宣布一项为期4年、资助经费4.16亿美元的新计划经费实施方案,促进该所旗舰项目“大规模基因组测序计划”。该项目致力于探索罕见遗传疾病的起因、加速基因组
Nature发布单细胞基因组学新技术
胚胎是如何形成我们肺脏、肌肉、神经和其他组织中的细胞的?一种新的方法可以解码使得胚胎万能细胞能够增殖并转变为机体许多特化细胞类型的遗传指令。 一开始是一团相同的细胞,随着增殖不断地改变形状和功能,最终变为我们肺脏、肌肉、神经和机体所有其他特化组织中的细胞。胚胎拥有这种创造奇迹的能力。
研究指出基因组学引领生物育种变革
记者从近日举行的第五届国际农业基因组会议暨深圳国际食品谷研讨会上获悉,现代农业研究已迈入生物组学大数据时代,特别是基因组学及其衍生技术在生物育种中发挥着重要的引领作用。 基因组学是对生物体所有基因进行集体表征、定量研究及不同基因组比较研究的一门交叉生物学学科。基因组学主要研究基因组的结构、功能
杂交稻基因组学研究获进展
中科院上海生科院植物生理生态研究所韩斌院士课题组联合中国水稻所杨仕华等团队,在杂交稻基因组学及杂种优势遗传机制研究中获重要进展,2月5日,相关成果在线发表于《自然—通讯》杂志。 据介绍,杂交水稻育种技术的成功是我国近几十年来取得的一项重要科技成就。伴随着汕优63、两优培九等一大批高产杂交稻品种
解决基因组学重要挑战的新工具
单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术,可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多,但是,仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列,从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前,去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列,还是一个手动和耗时的过程,为了去除污染
Neogen农业基因组学解决方案(二)
遗传异常测试遗传病不仅会导致生产商的经济损失,还会对牲畜造成过大的压力。在接种前的遗传测试可以给生产商提供必要的信息,以做出最佳的接种决定,从而避免遗传病,诸如:• 小腿弯曲(多发性关节硬化症)• 神经性脑积水(NH)• 先天性西昌趾(挛缩性蜘蛛指综合征)• 肺发育不良,并全身水肿(PHA)
Illumina传奇(二):基因组学领域的巨无霸
Illumina的圣地亚哥总部与硅谷的科技园有些相似。走廊上非常明亮,即使是雾天也不例外,空间宽敞可以供员工们工作、喝咖啡和自助用餐,不过食物并不是免费的,这在一定程度上证明了资源被有效利用。高层管理人员与其他人一起在隔间工作,没有专门的办公室。在deSouza担任CEO的第一周,他将行政楼层的隔间
Neogen农业基因组学解决方案(三)
猪的基因组学解决方案GeneSeek 的猪基因组学解决方案为窥探猪的遗传结构打开了一个重要的窗口,包括是否易感染治疗昂贵的疾病以及繁殖中对想要性状的锁定。GeneSeek猪全基因组低密度微珠芯片该微珠芯片提供约 10,000个 SNP,包括经常使用的 USDA血统和身份 SNP、用于识别品种的 SN
于军:基因组学的未解之谜
DNA测序技术使我们几乎可以肆无忌惮地获取任何物种和其群体的遗传信息。我们同时也要思考:生物学,尤其是基因组学,还有哪些未解之谜? “人类基因组计划”开启了诸多前所未有的新学科分支(基因组学、生物信息学、蛋白质组学等),推动了科学研究的平台化和规模化,比如高性能计算和规模化生物学数据获取。
Neogen农业基因组学解决方案(一)
纽勤农业基因组学: 增强全球食品安全纽勤的子公司GeneSeek 是全球领先的农业基因组学实验室,自1998 年起便开始提供全面的兽医和农业基因组学诊断解决方案。在农产品生产商需要就畜群作出决定时,GeneSeek 可为其提供必要的信息,进而为农场内的食品安全问题提供基因组学解决方案。GeneS
高原鱼类进化与功能基因组学科组
青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii),隶属于鲤科裂腹鱼亚科,是国家二级保护动物,仅分布于典型高原咸水湖泊—青海湖中,是维持青海湖“水-鸟-鱼”生态链稳定的核心物种。青海湖裸鲤是鲤科鱼类中唯一一种适应青海湖高盐碱水环境的自然群体,是研究高原鱼类适应进化的良好素材。青海湖裸鲤
全面解读药物基因组学基因检测技术
全面解读药物基因组学基因检测技术FDA和CFDA分别于2010和2012年将CYP2C19基因检测的重要性说明纳入氯吡格雷的药物说明书。在国内,阜外医院已完成氯吡格雷用药基因检测超过20000例,居全国单中心检测量之首。以下列出了药物基因组学涉及的主要基因及对应的个体化用药:(4) 以下为上述三大
Nature专题:穿过迷雾看肺癌
肺癌是造成癌症死亡的主要原因,主要分为小细胞肺癌(15%)和非小细胞肺癌两大类,其中非小细胞肺癌又可分为腺癌(40%)、鳞状细胞癌(30%)和大细胞癌(15%)。不同类型的肺癌,治疗策略和预后情况也不尽相同。 十几年来肺癌发病率在中国攀升得很快,这主要是因为吸烟人数快速增加(大多是男性),据统
肺癌的早期症状有哪些?
咳嗽:持续咳嗽或咳嗽加重,尤其是有痰或咳血。 呼吸困难:感觉呼吸急促或气短,尤其是在活动或躺下时。 胸痛:胸部不适或疼痛,可能会向肩膀或背部放射。 声音嘶哑:声音变得沙哑或嘶哑,可能是因为肿瘤压迫了喉咙神经。 体重下降:没有明显原因的体重下降。 疲劳:感到疲劳或虚弱,可能是因为肿瘤消耗
小细胞肺癌的辅助检查
胸部普通X线检查,是最简单易行,且廉价的检查方法。 胸部计算机X线体层摄影(CT):能显示普通X线检查所不能发现的病变,显示肺门淋巴结及纵隔内受累的范围及程度。 核磁共振成像(MRI):在发现肺部小病灶方面不如CT,但可较明显显示肿瘤与大血管之间的关系。在明确有无颅内转移时,增强MRI为首选
转移性肺癌的介绍
转移性肺癌系指任何部位的恶性肿瘤通过各种转移方式转移至肺部的肿瘤。约60%以上的恶性肿瘤初次就诊时就有肿瘤转移,其中30%~50%肿瘤转移到肺部。不同部位的肿瘤转移到肺部的发生率不同,其中,甲状腺癌、乳腺癌、肾癌、绒毛膜癌、骨肉瘤发生率最高,可达60%~90%,肝癌、胃癌、结直肠癌、前列腺癌次之
浅谈肝癌与肺癌的危害
核心提示: 肝癌是发生在肝脏上的恶性肿瘤,肺癌是发生在肺部上的恶性肿瘤,肝癌和肺癌两者都是属于恶性肿瘤疾病,两种疾病都比较严重。肝癌和肺癌都分为早期、中期和晚期,在早期这两种疾病一般没有特别明显的症状和表现,发生到中期时症状会逐渐显现出来,发展到晚期之后会引起强烈的不适。
【小细胞肺癌】临床表现
多发群体 吸烟人群为高发人群,小细胞肺癌患者中90%以上的人有吸烟史。发病年龄35-68岁,平均发病年龄60岁,男性多于女性。 疾病症状 小细胞肺癌早期可无症状,诊断时最常见的症状为乏力(80%)、咳嗽(70%)、气短(60%)、体重下降(55%)、疼痛(40-50%)、咯
非小细胞肺癌的病因
1.吸烟 目前认为吸烟是肺癌的最重要的高危因素,烟草中有超过3000种化学物质,其中多链芳香烃类化合物(如:苯并芘)和亚硝胺均有很强的致癌活性。多链芳香烃类化合物和亚硝胺可通过多种机制导致支气管上皮细胞DNA损伤,使得癌基因(如Ras基因)激活和抑癌基因(如p53,FHIT基因等)失活,进而引