EMBOreports:sncRNA可能是癌症的征兆

目前,癌症基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas,TCGA)的研究人员得出结论:小分子非编码RNA(small non-coding RNAs,sncRNAs)可以用来预测一个人是否患有乳腺癌。这项研究成果发表在2014年2月17日的国际知名杂志《EMBO reports》上,表明特定类型的非编码RNA的水平差异,可以用来区分癌组织和非癌组织,还可以把癌症患者分成具有不同生存结果的亚组。 sncRNAs是细胞内不产生蛋白质、但具有其它重要功能的RNA分子。本研究的共同第一作者、加拿大西蒙弗雷泽大学和不列颠哥伦比亚大学的教授、 BC癌症机构(BC Cancer Agency)的杰出科学家Steven Jones解释说:“多年来,靠近转录起始位点的sncRNAs因其明显的无序分布,及其与已知功能或疾病之间的相关性,一直被视为‘转录噪音(transcriptional noise)......阅读全文

Nature新闻:读取癌症的基因组蓝图

  在过去的10年里,人类基因组测序从划时代的科学成果进入到了商业化的阶段。新一代的测序(NGS)设备结合强有力的生物信息学使得研究人员常规概览各种肿瘤类型扭曲及受损的基因组图谱成为可能。相应地,公司、临床研究团体和学术中心正竞相将来自癌症基因组学不断增长的数据转变为一些靶向性的、患者特异性的治疗策

PNAS:探查癌症基因组ncRNA“暗物质”

  来自西奈山Icahn医学院的研究人员在癌细胞中发现了一组可以激发免疫反应的非编码RNA分子,它们具有与病原体相似的一些特征。由于这些分子在癌症中表达并扩增,它们造成的免疫反应有可能影响了癌症的生长。这项研究发布在《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。  研究人员是通过探查基因组“暗物质”组成部分

Cell新文章:癌症全基因组测序

  根据华盛顿大学医学院的一项新研究,具有吸烟史的肺癌患者相比于不吸烟的肺癌患者肿瘤中的遗传突变要多10倍。这一研究在线发表在9月13日的《细胞》(Cell)杂志上。   论文的资深作者、华盛顿大学基因组研究所主任Richard K. Wilson 说:“吸烟者基因组具有比不吸烟的肺癌患者基因

基因组学:-跨越癌症研究国界

  1982年11月,在尼日利亚海军医院外足球场上踢球的一名军官,突然摔倒死亡。这名男子被带到急诊室时,当时还是一个新人的 Olufunmilayo Funmi Olopade医生正在值班。“我们搞不明白为什么他死亡,这让我感到震惊,从那时开始我意识到,我需要做更多的工作来理解和帮助人们。”Ol

癌症基因组项目(TCGA)完成之反思

  经过美国不懈的努力,涉及上万个癌基因的癌基因组项目正式告一段落。该项目在2006年开始,预计花费1亿美元进行研究,并且癌症基因组图谱(TCGA)现在已经成为国际癌症基因组协会最大的组成部分,该项目汇聚了来自16个国家的科学家,并发现了接近10万个与癌症相关的基因突变。  现在的问题是,下一步怎么

华人女学者:预测癌症和死亡的新方法

  表观遗传学年龄是衡量你生物学年龄的一种新方法。最近,美国西北大学的一项研究表明,当你的生物学(表观遗传学)年龄大于你的实际年龄时,你患癌症的风险就会增加。而且,这两种年龄之间的差异越大,罹患癌症的风险就越高。相关研究结果发表在2月15日的《EBioMedicine》。  本研究通讯作者侯丽芳(音

人工智能预测患者的癌症起源和治疗反应

  麻省理工学院(MIT)和丹娜-法伯癌症研究所的研究人员在国际顶尖医学期刊 Nature Medicine 上发表题为:Machine learning for genetics-based classification and treatment response prediction in c

研究发现细胞的快速循环或能预测癌症的发生

  如今科学家们对癌症的进展进行了广泛的研究,而且还对癌症进展的关键步骤进行了图谱绘制(至少在某些实体瘤中),介导癌症风险的基因的损伤往往会积累,并改变正常的细胞行为,从而诱发早期癌细胞的出现,最终会诱发正常细胞转变为恶性癌细胞。  图片来源:CC0 Public Domain  近日,一项刊登在国

Nature-Methods:科学家成功使用AI预测癌症进化

  一个来自英国和美国的联合研究团队已经开发出了一种使用人工智能预测肿瘤可能如何改变以及如何在病人体内传播的方法,相关研究成果于近日发表在《Nature Methods》上,题为“Detecting repeated cancer evolution from multi-region tumor

科学报告:化学计算能够预测癌症的发生

  最近,赖斯大学的科学家们开发出了一种鉴别癌前体细胞何时会变成成熟的癌症的方法。  血液中的生物标记物可能会揭示出突变的细胞是否已转向形成肿瘤,以及这一过程可能需要多长时间(取决于癌症类型)。这可以使患者意识到他们生病之前面临的风险。  在最近一项研究中,Anatoly Kolomeisky与博士

从《我不是药神》看预测性癌症基因检测

  近日,随着电影《我不是药神》的观影热潮,“慢性粒细胞性白血病”“格列卫”等恶性肿瘤有关的词汇成为焦点。癌症,是众多健康人群的恐惧中心。预测性癌症基因检测也随之日渐火爆起来。   最早将预测性癌症基因检测带入公众视野的是著名影星安吉丽娜·朱莉。2013年2月,朱莉决定切除双侧乳腺,因为她检测了自己

利用数学增模型来预测癌症的发展趋势

  近日,来自杜克大学的数学家通过研究开发出了一种新方法,该方法可以帮助医生们预测不同类型的癌症如何发展,尤其是当肿瘤的尺寸无法测量时,相关研究发表于国际杂志Bulletin of Mathematical Biology上。  在美国超过三分之一的个体都会在其生命阶段的某个时刻被诊断为癌症,而对肿

华大等机构发布强大的基因组预测工具

  植入前遗传学诊断(PGD),被用来检测亲本传递给其体外受精(IVF)胚胎的大染色体异常或遗传突变。然而,这种技术不能全面扫描胚胎的基因组以检测自发突变。2月11日在《Genome Research》发表的一项研究中,来自华大基因科技、Complete Genomics、美国Reprogeneti

全球基因组测序市场展望与预测(20212026)

行业洞察  2020 年全球基因组测序市场规模为 29 亿美元,预计到 2026 年将达到 50 亿美元,2021-2026 年的复合年增长率为 9%。  癌症病例的不断增加正在成比例地增加市场上基于测序的诊断和治疗方案的数量。随着制药和生物技术公司对基因组测序表现出浓厚的兴趣,供应商提供了新一代测

透过大规模基因组分析推出-泛癌症图谱-开启癌症治疗

  【Technews科技新报】美国国立卫生研究院(NIH)资助的研究团队已经完成了一份详细的基因组分析,这个被称为泛癌症图谱(PanCancer Atlas)的研究结果收录了 27 篇论文,并包含了 33 种癌症、1 万多个种不同肿瘤分子和临床讯息的数据资料。   泛癌症图谱主要是针对癌症基因组

数字PCR技术精确检测癌症基因组扩增

  来自斯坦福大学以及Bio-Rad的研究人员证实,数字PCR系统能够精确测定长期存放的癌组织样本中的癌症基因组扩增。该研究成果发表在《Translational Medicine》杂志上。   某些拷贝数变异(如基因组扩增)可能导致特定癌基因的过表达,推动癌症发展。靶定扩增的癌基因有望实现癌

证实基因组测序成功鉴定癌症相关突变

  最近,UT西南医学中心的癌症研究人员表明,全基因组测序可以用来确定患者遗传性癌症的风险,这可能会促进癌症的预防、诊断和护理。  这项研究首次采用全基因组测序来评估258名癌症患者的基因组,以提高癌症诱发突变的诊断能力。相关研究结果发表在12月份的国际期刊《EBioMedicine》。  UT西南

大规模癌症基因组研究发表《Nature》文章

  髓母细胞瘤是儿童最常见的恶性脑瘤。大多数患者年龄在16岁以下。主要有4个亚组:Wnt、Sonic Hedgehog (SHH)、3组和4组。这些亚群由不同基因变化驱动,起始于不同细胞,常常表现出不同临床状况。Wnt组中,约95%患者可以成为长期存活者,3组患者只有50%。目前,尚无针对3组和4组

大象为啥不生癌症?秘密在基因组里

  今年的诺贝尔化学奖让我们对DNA损伤修复的研究有了一些认识,知道DNA损伤非常容易发生,但是生物进化获得了能修复这些损伤的系统。尽管如此,在多细胞生物大量DNA损伤和修复过程中,仍然无法完全避免出现DNA发生突变的后果,这些突变大多数情况下容易带来肿瘤等恶劣后果。  如果所有细胞都存在类似的DN

大型研究为癌症基因组分析奠定基础

  12月9日,国际癌症基因组协会(ICGC)在著名的《Nature Communications》杂志,发表了一篇令人瞠目的文章,它为即将到来的癌症基因组学研究时代,奠定了基础。该项目,是由Centro Nacional de Analisis Genómico (CNAG-CRG)和German

Nature:癌症基因组分析的新浪潮

  肺癌与乳腺癌不一样,与胰腺癌也不一样,然而根据发表在《自然遗传学》(Nature Genetics)的两项最新研究表明在分子水平上它们具有许多相同之处。同日,Nature网站对这一研究成果进行了即时新闻报道   这项“泛癌症”研究针对12种不同类型的肿瘤3000多个基因组进行了分析,寻找跨

Nature:癌症基因组分析的新浪潮

  肺癌与乳腺癌不一样,与胰腺癌也不一样,然而根据发表在《自然遗传学》(Nature Genetics)的两项最新研究表明在分子水平上它们具有许多相同之处。同日,Nature网站对这一研究成果进行了即时新闻报道   这项“泛癌症”研究针对12种不同类型的肿瘤3000多个基因组进行了分析,寻找跨

Nature:全基因组测序重新定义癌症之王基因组突变蓝图

  近日,一项发表于国际著名杂志Nature上的研究论文中,来自英国和澳大利亚的研究人员对100位胰腺癌患者癌症组织的基因组进行了深入分析,结果发现了4种不同的亚型,这或许可以帮助后期开发治疗胰腺癌患者的新型疗法。文章中研究人员利用全基因组测序技术揭示了肿瘤基因组结构性改变的光谱模式,该技术可以帮助

数码DNA测试可帮助预测癌症患者的存活率

  一种新的以数码方式计数T细胞的DNA检测可对卵巢癌患者的存活预测有帮助。这些发现增添了证据,这些证据提示含有大量的一种被称为肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)的T细胞与卵巢癌患者存活率的改善有关。Harlan Robins及其同事研发了一种基于DNA的测试,它能够以数码的方式对任何存在于某组织样本中

科学家称可通过DNA检测提前预测癌症发病

X射线下的乳房肿瘤----美联社   据卡塔尔半岛电视台网站8月5日报道,俄罗斯科学家宣布他们可以通过DNA检测提前三到五年预测到癌症的发病。如果这是真的,这将为癌症的预防和治疗打开新的视野。   “俄通社-塔斯社”周一援引莫斯科大学第一医学院新闻办公室消息称,医学院专家们发现了一种能够提前三到

Science发布癌症重要成果:能预测反应的新技术

  两个研究组研发出了一种新型技术,能实时追踪癌症治疗复合疗法的疗效,这两个分别来自Fred Hutchinson 癌症研究中心,以及麻省理工的研究组将他们的研究成果发表在4月22日的Science Translational Medicine杂志上。  随着研究的深入,我们逐渐了解了肿瘤生物学,但

Science:癌症基因组中的突变“热点”不一定会推动癌症

  Science一篇文章描述了DNA单链如何以所谓的"发夹"结构折叠起来,对许多癌症中表达的基因编辑酶的突变高度敏感。但是,这些突变"热点"中的许多发生在与癌症完全无关的基因中,包括基因组的许多非编码区域。图片来源:Science  MGH癌症中心的Dr.Michael Lawrence说:"一个

全球癌症基因组图谱计划又一研究突破

  最近,发表在国际杂志the New England Journal of Medicine上的一篇研究论文中,来自从事癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas)研究计划的科学家通过进行研究,对第二种常见类型的肾癌的两种类型进行了分子特性的分析,并且对这种常见类型的肾癌进行了

癌症研究人员联手汇集肿瘤基因组数据

   研究人员希望,数据分享将为利用诸如这些脑部腺癌细胞等肿瘤的基因组信息带来更好的方法。  这是为大型癌症研究中心的很多病人提供的最新希望:“让我们测序你的肿瘤,或许我们能将其同击败这种恶性疾病的药物匹配。”不过,现实是基因组分析仍然仅为癌症病人提供了一小部分帮助。“我们多半时候不知道如何处理这些

-【Cell综述】从癌症基因组到精准肿瘤学

  迅速发展的基因组技术让有限的肿瘤活检材料获得更广泛的分子分析,从而促进更广泛地实施个性化癌症治疗。以基因组为基础通过不同肿瘤的患者分类化目前还不太可能取代在解决临床需要时对组织来源的考虑,包括开发和实施新的合理目标的肿瘤疗法。  1是否要再分类  在本综述的讨论中考虑以基因组为基础的病人分类,要