成都生物所在系统发育基因组学研究方法中获进展
系统发育基因组学研究，主要是利用基因组/转录组数据和基因组学方法解决重要类群的进化关系，从而揭示物种起源与分化以及多样性形成机制等重要问题。与传统的系统发育研究相比，系统发育基因组学具有信息量大、结果可靠的优点。但是在这个新兴的领域，研究方法的发展严重滞后于数据量的爆炸式增长。传统的方法在处理成千上万个基因数据时运算较慢，存在难以克服的系统误差(如速率异质性)。为此，科研人员新提出了“一个基因一个性状”的系统发育基因组学研究方法，以更好地适应系统发育基因组学发展的要求。 龟在四足动物中的系统发育位置长期以来备受争议。在龟是和鸟类还是蜥蜴的亲缘关系更近的问题上，不同的研究会存在相互矛盾的结论。 中国科学院成都生物研究所系统进化与保育学科组吕彬博士和傅金钟研究员通过测定乌龟的转录组，得到了4584个同源基因，同时使用了传统方法和“一个基因一个性状”的方法进行推断。传统的系统学方法强烈地支持龟与鸟和鳄鱼的亲缘关系最近，......阅读全文
Neogen农业基因组学解决方案（二）
遗传异常测试遗传病不仅会导致生产商的经济损失，还会对牲畜造成过大的压力。在接种前的遗传测试可以给生产商提供必要的信息，以做出最佳的接种决定，从而避免遗传病，诸如：• 小腿弯曲（多发性关节硬化症）• 神经性脑积水（NH）• 先天性西昌趾（挛缩性蜘蛛指综合征）• 肺发育不良，并全身水肿（PHA）
2011国际基因组学大会在长春召开
10月23日，由中科院、吉林省政府主办的2011国际基因组学大会暨中国北方药用物种基因组学转化研究中心成立仪式在吉林省长春市举行。海内外200多名知名专家学者出席大会。 与会专家学者围绕“基因组学时代的机遇与挑战”主题，从“基因组科学”“基因组技术”“基因组信息学与计算生物学”，及“基因组
英国基因组学研究进展迅速
随着基因数据的逐渐增多，临床医生能够更好地治疗患者，同时减少医疗事故的发生。英国国家医疗服务体系(National Health Service，NHS)中的许多遗传学中心现在都在使用芯片和外显子测序。 近日，英国卫生大臣Jeremy Hunt和生命科学部长George Freeman将宣布新
Nature发布单细胞基因组学新技术
胚胎是如何形成我们肺脏、肌肉、神经和其他组织中的细胞的?一种新的方法可以解码使得胚胎万能细胞能够增殖并转变为机体许多特化细胞类型的遗传指令。 一开始是一团相同的细胞，随着增殖不断地改变形状和功能，最终变为我们肺脏、肌肉、神经和机体所有其他特化组织中的细胞。胚胎拥有这种创造奇迹的能力。
基因组学推动生命科学大步向前
2010年下旬，河南安阳曹操墓真伪之辩正酣。而一则来自上海的重磅消息更是引发了多方关注。复旦大学现代人类学教育部重点实验室宣布，向全国征集曹姓男性DNA样本，拟用基因组科学的手段验证出土的头骨是否为曹操本人。 一下子，基因组科学成为热门，这一话题“落入寻常百姓家”。 事实上，伴随着2
Neogen农业基因组学解决方案（三）
猪的基因组学解决方案GeneSeek 的猪基因组学解决方案为窥探猪的遗传结构打开了一个重要的窗口，包括是否易感染治疗昂贵的疾病以及繁殖中对想要性状的锁定。GeneSeek猪全基因组低密度微珠芯片该微珠芯片提供约 10,000个 SNP，包括经常使用的 USDA血统和身份 SNP、用于识别品种的 SN
Nature发布比较基因组学研究重要发现
来自杜克大学医学院、Brigham妇女医院和哈佛医学院的研究人员，发现了一个机制可以解释：一些遗传突变在一种基因组中会致病，而在另一种基因组中则为良性的原因。 在发表于6月29日《自然》（Nature）杂志上的研究论文中，研究人员比较了成千上万的人类致病突变与大约100个动物物种的相似序列。
基因组学将如何进入日常医学？
随着大规模的DNA结果越来越多的可供病人和保健提供者使用，医学界在酝酿着一次平静的转换。在一连串的数据当中，医生、顾问和家庭正在梳理如何更好地理解这些信息，并将其用于医疗决策的制定。 最近，在两大儿科医院举行的临床遗传学会议上，来自多家机构的专家提出了他们对于“基因组整合到临床实践”的第一份建
家犬基因组学研究获新进展
科学界对于家犬的起源和驯化一直争议不断。近日，中科院院士张亚平带领团队发现，家犬中亚起源的假说与基于全基因组重测序数据分析的家犬东亚南部起源模式相冲突。相关成果日前在线发表于美国《国家科学院院刊》。 2015年，美国学者Shannon等人通过分析大量的家犬群体全基因组DNA芯片数据，提出了家犬
高原鱼类进化与功能基因组学科组
青海湖裸鲤（Gymnocypris przewalskii），隶属于鲤科裂腹鱼亚科，是国家二级保护动物，仅分布于典型高原咸水湖泊—青海湖中，是维持青海湖“水-鸟-鱼”生态链稳定的核心物种。青海湖裸鲤是鲤科鱼类中唯一一种适应青海湖高盐碱水环境的自然群体，是研究高原鱼类适应进化的良好素材。青海湖裸鲤
Illumina传奇（二）：基因组学领域的巨无霸
Illumina的圣地亚哥总部与硅谷的科技园有些相似。走廊上非常明亮，即使是雾天也不例外，空间宽敞可以供员工们工作、喝咖啡和自助用餐，不过食物并不是免费的，这在一定程度上证明了资源被有效利用。高层管理人员与其他人一起在隔间工作，没有专门的办公室。在deSouza担任CEO的第一周，他将行政楼层的隔间
协同创新驱动农业基因组学发展
“作为生物技术领域最基础的学科，农业基因组学研究不仅需要国内外科学家同行的协同创新，更需要与生物技术产业发展需求无缝衔接，才能发挥出农业基因组学的最大潜能。基于这种认识，在国家农业科技创新联盟的框架下，建立农业基因组学的协同创新联盟就显得十分迫切。”中国农科院科技局局长梅旭荣表示。 7月24
研究指出基因组学引领生物育种变革
记者从近日举行的第五届国际农业基因组会议暨深圳国际食品谷研讨会上获悉，现代农业研究已迈入生物组学大数据时代，特别是基因组学及其衍生技术在生物育种中发挥着重要的引领作用。 基因组学是对生物体所有基因进行集体表征、定量研究及不同基因组比较研究的一门交叉生物学学科。基因组学主要研究基因组的结构、功能
安捷伦科技发布基因组学站式网站
2010年4月19日，北京 – 安捷伦科技公司(NYSE：A)日前发布了一个全新的的动态基因组学网站，genomics.agilent.com。 此网站将是所有基因组学资源的一站式供应点。用户可在其中找到众多组织有序、易于查找的信息，从最新的科学进展到最热门的产品一应俱全。此网站以一体化网
于军：基因组学的未解之谜
DNA测序技术使我们几乎可以肆无忌惮地获取任何物种和其群体的遗传信息。我们同时也要思考：生物学，尤其是基因组学，还有哪些未解之谜? “人类基因组计划”开启了诸多前所未有的新学科分支(基因组学、生物信息学、蛋白质组学等)，推动了科学研究的平台化和规模化，比如高性能计算和规模化生物学数据获取。
解决基因组学重要挑战的新工具
单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术，可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多，但是，仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列，从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前，去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列，还是一个手动和耗时的过程，为了去除污染
解决基因组学重要挑战的新工具
单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术，可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多，但是，仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列，从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前，去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列，还是一个手动和耗时的过程，为了去除污染
美国推动基因组学转向临床医学
美国政府将用数亿美元积极推动基因组学向临床医学的转化，探索基因组学的新前沿。12月6日，国立卫生研究院（NIH）所属国家人类基因组研究所宣布一项为期4年、资助经费4.16亿美元的新计划经费实施方案，促进该所旗舰项目“大规模基因组测序计划”。该项目致力于探索罕见遗传疾病的起因、加速基因组
Neogen农业基因组学解决方案（一）
纽勤农业基因组学: 增强全球食品安全纽勤的子公司GeneSeek 是全球领先的农业基因组学实验室，自1998 年起便开始提供全面的兽医和农业基因组学诊断解决方案。在农产品生产商需要就畜群作出决定时，GeneSeek 可为其提供必要的信息，进而为农场内的食品安全问题提供基因组学解决方案。GeneS
杂交稻基因组学研究获进展
中科院上海生科院植物生理生态研究所韩斌院士课题组联合中国水稻所杨仕华等团队，在杂交稻基因组学及杂种优势遗传机制研究中获重要进展，2月5日，相关成果在线发表于《自然—通讯》杂志。 据介绍，杂交水稻育种技术的成功是我国近几十年来取得的一项重要科技成就。伴随着汕优63、两优培九等一大批高产杂交稻品种
全面解读药物基因组学基因检测技术
全面解读药物基因组学基因检测技术FDA和CFDA分别于2010和2012年将CYP2C19基因检测的重要性说明纳入氯吡格雷的药物说明书。在国内，阜外医院已完成氯吡格雷用药基因检测超过20000例，居全国单中心检测量之首。以下列出了药物基因组学涉及的主要基因及对应的个体化用药：（4） 以下为上述三大
英国成立功能基因组学实验室
近日，英国科研与创新署（UKRI）宣布，医学研究理事会（MRC）、剑桥大学米尔纳治疗研究所（MTI）等联合成立功能基因组学实验室，作为英国卓越研究中心和国家资源中心，汇集英国生命健康领域学术界、产业界优势和专业知识，加速新药物和诊断方法的研究发现，巩固英国在全球基因组学方面的领先地位。 该实验
基因组学结合传统育种获得优质主食作物
“我喜欢这个。”Ismail Rabbi边说边将手掌放在木薯上，就像父母在夸赞自己心爱的孩子，他羞涩地笑了。“它们看上去没什么了不起的——并不高。”Rabbi说，“但它克服了我们设置的所有障碍。” Rabbi是尼日利亚伊巴丹国际热带农业研究所（IITA）的遗传学家。他和同事正在开展一项改良木
美X大奖基因组学挑战赛流产
图片来源：美国国家人类基因组研究所 美国X大奖基金会宣布废止其备受瞩目的奖金为1000万美元的基因组学挑战赛。报名截止时，该比赛仅吸引了两组竞争者参加。不过发言人表示，取消竞赛的决定与参赛人数无关。 7年前，阿康基因组学X大奖高调设立。该奖项旨在通过提供1000万美元奖金，推动医学基因组
英国成立功能基因组学实验室
近日，英国科研与创新署（UKRI）宣布，医学研究理事会（MRC）、剑桥大学米尔纳治疗研究所（MTI）等联合成立功能基因组学实验室，作为英国卓越研究中心和国家资源中心，汇集英国生命健康领域学术界、产业界优势和专业知识，加速新药物和诊断方法的研究发现，巩固英国在全球基因组学方面的领先地位。 该实验
解局：腾飞前夜的基因组学检测市场
2001年是一个遥远的年份。那一年，维基百科刚刚上线，苹果公司推出了第一代iPod，微软的操作系统也仅停留在Windows XP。但如果论对未来的影响，这些成果或许都比不上人类基因组草图的公布。在短短的15年里，基因/基因组测序从昂贵的科研项目，迅速成为了可靠且价格合适的工具。它推动了靶向药物与
桫椤保护基因组学研究取得新进展
中国科学院华南植物园研究员康明团队在国家自然科学基金、广东省重点领域研发计划、广东基础与应用基础研究旗舰项目等项目的资助下，基于三种桫椤属植物的全基因组重测序数据，在树蕨保护基因组学研究方面取得新进展。相关成果近日发表于《植物杂志》（The Plant Journal）。 树蕨是一类形态独特的
2013国际基因组学大会在青岛召开
10月29日，由中科院北京基因组研究所、中国遗传学会、中国海洋大学等单位主办的“2013国际基因组学大会”在青岛召开。来自美国、加拿大、德国、瑞士等国家的著名科学家和我国相关领域的知名学者与会，以“基因组学的突破和转化”为主题，交流和研讨基因组学研究的最新进展和成果。 本届大会首次为海洋与水产
基因组学常规流程中SPIA通路分析方法
基因组学常规流程中通过实验样本组与组之间的比较得到成千上百的差异基因，再通过通路分析，从生物学角度探究差异基因的功能。但是常规的ORA、FCS方法往往忽视了基因在通路中复杂的相互作用关系，所以给大家介绍一种考虑更周全的分析方法SPIA。 SPIA整合了差异倍数、基因集显著性和拓扑分析，为每条通路计算
国际遗传和医学基因组学大会近日召开
日前，安捷伦科技有限公司作为主要赞助商参与了于6月9日至11日在香港大学举行的国际遗传和医学基因组学大会。该次国际会议由美洲华人遗传学会和香港医学遗传学会在历年分别举办的国际学术会议的基础上首次联合举办。会议吸引了国内外从事遗传学和医学基因组学研究的知名学者参与。诺贝尔奖获得者Oliver Smit