Cell:寻找癌症的幕后推手

哥伦比亚大学医学院(CUMC)的研究团队,开发了分析基因调控和信号网络的新工具。他们通过这一工具发现,KLHL9基因缺陷是胶质母细胞瘤(一种最常见的脑癌)背后的重要推手。CUMC团队在小鼠模型中重新引入KLHL9蛋白,结果成功抑制小鼠体内的肿瘤,为这种致命疾病提供了潜在的新治疗策略。这一成果发表在十月九日的Cell杂志上,领导这项研究的是CUMC 的Andrea Califano教授。 该研究团队还用同样的方法,鉴定了与乳腺癌和阿尔茨海默症有关的可遗传变异。研究表明,研究人员开发的新算法与细胞调控模型相结合,能够帮助人们快速鉴定多种疾病的遗传病因。 在之前的研究中,Dr. Califano及其同事曾通过计算机模型发现,特定类型的癌症具有高度保守的“主调控子”,即疾病发展所必需的基因。不过,这些模型并不能体现引起主调控子异常活性的关键突变。 在这项新研究中,研究团队开发了被称为DIGGIT(Driver-Gene Inf......阅读全文

细胞系错误鉴定:终结的开始(一)

2010年5月ATCC SDO(Standards Development Organization)工作组在Nature review cancer杂志上发表了题为《Cell line misidentification:the beginning of the end》前瞻性报道。以下是

黑素细胞的氨银法鉴定方法介绍

  主要用于鉴定黑色素颗粒和嗜银颗粒。黑色素是一种非脂溶性、非血色素性的色素颗粒,呈黑褐色,存在于头发、皮肤、视网膜、虹膜及中枢神经系统的某些部分。嗜银颗粒分布在类癌组织。染色后嗜银颗粒和黑色素均呈黑色,细胞核呈粉红色,细胞浆呈淡红色。

研究开发出细胞身份鉴定新型AI引擎

随着单细胞和空间组学技术的快速发展,公开可共享数据量已突破亿级大关。然而,技术平台产生的差异、复杂疾病状态、跨物种研究带来的批次效应和离群细胞等,对数据解读构成挑战。面对动辄百万规模的离群细胞,传统的“先聚类、后注释”分析方法难以快速、精准且可解释地将这些“身份不明”的细胞映射到参考细胞图谱上,进而

植物细胞的活体染色和死活的鉴定

一、目的练习以碱性染料中性红进行活体染色的方法。通过活体染色及质壁分离,进行细胞死活的鉴定。二、原理用某种对植物无害的染料稀溶液对活细胞进行染色称活体染色。中性红是常用的活体染料之一。在中性或微碱性环境下,植物的活细胞能大量吸收中性红并向液泡排泄,液泡一般呈酸性,进入液泡的中性红解离出大量阳离子而呈

植物细胞的活体染色和死活的鉴定

实验概要用某种对植物无害的染料稀溶液对活细胞进行染色称活体染色。中性红(2-甲基-3-氨基-6-二甲氨基二氮杂蒽盐酸盐,  3-氨基-6-二甲氨基-2-甲基吩嗪盐酸盐,Neutral red,Neutral red chloride, Toluylene red,  Aminodimethylami

细胞系错误鉴定:终结的开始(二)

案例和影响交叉污染和错误鉴定已有一段很长的历史,这其中有许多的案例,我们很难去判断哪一个是最重要及代价最高的。已被描述的经典案例是Hela细胞污染(关于Hela细胞污染有好几个案例),令人惊奇的是,许多被Hela细胞污染的细胞系居然在一些备受尊敬的杂志上仍被使用,而这一使用距离它们最先发现为Hela

细胞株的污染鉴定、预防和处理

普通微生物污染:培养基浑浊,高倍镜观察有微生物污染;按规定弃用并全面严格灭菌。支原体污染:显微镜无法观察,依经验表现为细胞生长缓慢,有细胞漂浮等等,应通过PCR 等方法鉴定,如发现支原体污染,应按规定弃用,实验室要及时全面消毒灭菌,防止蔓延。(有些常规性细胞学实验不受支原体污染影响,可以继续使用细胞

细胞系错误鉴定:终结的开始(三)

交叉污染检测许多方法已被用来检测交叉污染,包括同工酶分析、核型分析、人类白细胞抗原(HLA)分型,免疫分型和DNA指纹识别。这些方法都可以鉴别出某一种细胞系,但是分辨能力各不一样。然而,这些方法在不同实验室所得到的数据却不尽相同,以致没有任何一种方法可以用来建立一个标准参考数据库。许多实验室利用ST

产单核细胞李斯特菌鉴定

产单核细胞李斯特菌在自然界分布很广,土壤、水、人和动物粪便中均可存在,常伴随EB病毒引起传染性单核细胞增多症,也可引起脑膜炎、败血症等。近年在发达国家常因污染奶制品引起食物中毒。该菌可通过眼及破损皮肤、粘膜进入体内而造成感染,孕妇感染后通过胎盘或产道感染胎儿或新生儿,也会引起女性阴道、子宫颈的感染,

研究首次鉴定出诱导多能干细胞高效产生T细胞种子细胞

  日前,Cell Research专业学术刊物在线发表了中国科学院广州生物医药与健康研究院王金勇课题组及合作团队围绕T细胞再生长期技术攻关取得的重要研究成果。该研究首次鉴定出诱导多能干细胞高效产生T细胞种子细胞(T cell Precursors)的关键转录因子组合Runx1和Hoxa9,为再生T

未分化的牙髓干细胞DPSCs和乳牙干细胞SHEDDE鉴定

实验方法原理 STRO-I是MSC的早期细胞标志分子之一,可用于鉴定DPSCs和SHED的未分化状态。STR0-1的单克隆抗体首先是作为能与人骨髓CFU-F细胞表面高表达的分子作用的试剂被大家所认识的。DPSC和SHED中含有大约10%〜20%的STRO-I阳性细胞。非常值得注意的一点,体外扩增后的

细胞化学词汇细胞癌基因

中文名称:细胞癌基因存在位置:正常的细胞基因组激活前作用:促进正常细胞生长增殖分化和发育激活后作用:使细胞发生恶性转化定义:存在于正常的细胞基因组中,与病毒癌基因有同源序列,具有促进正常细胞生长、增殖、分化和发育等生理功能。细胞癌基因:存在于正常的细胞基因组中,与病毒癌基因有同源序列,具有促进正常细

食管癌细胞系中干细胞样SP细胞的分离鉴定实验

实验材料 人食管癌细胞系试剂、试剂盒 胰酶RNA酶碘化丙啶四甲基偶氮唑盐小牛血清DMEMDMSOK2HPO4Na2HPO4NaCI仪器、耗材 无菌分选管400目细胞筛水浴锅离心机酶标仪电泳仪显微镜PCR仪实验步骤 一、材料准备1.  青霉素储存液(1)将青霉素小瓶中的80万单位的干粉充分溶解于8 m

通过转录组分析鉴定风筝果种子油脂代谢基因

  蓖麻油酸的脂肪酸链上含有一个羟基官能团,是一种特殊脂肪酸,具有粘度高、酸度低、耐高温、不易氧化、不易凝固等特点,在500~600℃高温下不变质、不燃烧,零下18℃ 的低温下不凝固等特殊性能。利用蓖麻油生成的化学衍生物已达3000多种,广泛应用于国防、航空、航天、化工医药和机械制造等,是目前能替代

转基因植物的分子检测与鉴定方法(三)

3  转基因植株外源基因表达情况的检测与鉴定尽管在mRNA水平也能一定程度地研究外源基因的表达,但存在mRNA在细胞质中被特异性地降解等情况,mRNA与表达蛋白质的相关性不高(相关系数低于0.5),基因表达的中间产物mRNA水平的研究并不能取代基因最终表达产物的研究。转基因植株外源基因表达的产物一般

转基因植物的分子检测与鉴定方法(一)

随着分子生物学和植物基因工程的不断发展,越来越多的育种工作者开始利用转基因技术获得常规育种技术难以得到的新种质和新品种。植物转基因技术最大的好处在于可以打破自然界物种间原有的生殖隔离,促进基因在不同物种间的交流,极大地丰富变异类型,增大遗传多样性,为植物新品种的培育提供丰富的育种资源。通过对基因功能

基因的转移与重组体的筛选和鉴定2

二、重组DNA分子转入真核细胞1. 根癌农杆菌Ti质粒介导法农杆菌介导的Ti质粒载体转化法是目前研究最多、机制最清楚、技术方法最成熟的基因转化途径。迄今为止约8096的转基因植株都是利用农杆菌介导转化系统获得的。农杆菌是一类土壤习居菌,革兰氏染色呈阴性,能感染双子叶植物和裸子植物,而对绝大多数单子叶

基因的转移与重组体的筛选和鉴定5

(二)目的克隆的鉴定经过初步筛选获得的阳性克隆,下一步必须对带有目的序列的克隆做进一步筛选和鉴定。鉴定一般有几种常用方法:(1)分子杂交;(2)免疫学检测;(3)DNA测序;(4)蛋白质活性筛选;(5)基因互补实验。1. 分子杂交核酸分子杂交有多种方法:原位杂交、点杂交及Southern杂交等。原理

应用多重PCR方法鉴定RHD基因型的研究

作者:徐华1,叶世辉1,王宝燕2,刘孟黎1,吴大洲1,贺晨1     作者单位:(1. 陕西省血液中心血型研究室,陕西西安710061;2. 西安交通大学医学院第一附属医院输血科,陕西西安710061)  【摘要】  目的建立一种可靠的PCR方法,用于RHD血型基因型的研究。方法根据RHD血型基因的

基因的转移与重组体的筛选和鉴定4

(3)插入表达筛选法与插入失活相反,插入表达法是外源目的基因插入特定载体后,能激活用于筛选操作的标记基因的表达,由此进行转化子的筛选。设计载体时,在筛选标记基因前面连接一段具有抑制作用的负调控序列,插入外源DNA将使该负调控序列失活,其下游的筛选标记基因才能表达。例如质粒pTR262有一个负调控的c

Science:鉴定出协助花香释放的基因PhABCG1

  在一项新的研究中,来自美国普渡大学、荷兰阿姆斯特丹大学和法语天主教鲁汶大学的研究人员分离出一种协助开花植物中的挥发性化学物释放的蛋白的编码基因。在他们发表在Science期刊上标题为“Emission of volatile organic compounds from petunia flow

转基因植物的分子检测与鉴定方法(四)

4.2 试纸条技术与ELISA原理相似,不同之处是以硝化纤维膜代替聚苯乙烯反应板为固相载体。先将特异性抗体吸附在膜上,将膜放入混有样品的溶液中,蛋白质随着液相扩散,遇到抗体,发生抗原-抗体反应,通过阴性对照筛选阳性结果,并给出转基因成份含量的大致范围。试纸条方法是一种快速简便的定性检测方法,将试纸条

转基因植物的分子检测与鉴定方法(二)

1.1.2.2  降落PCRTD-PCR是一种在一个反应管或少数几个反应管中通过一系列退火温度逐渐降低的反应循环来达到最佳扩增目的基因的PCR方案。它通过体系自身的代偿功能弥补以反应体系和并非完美的循环参数所造成的不足。此策略保证了最初形成的引物模板杂交体具最强的特异性。尽管最后一些循环采用的退火温

基因的转移与重组体的筛选和鉴定1

第一节 转化基因片段在体外只是一段核酸分子,是化学物质,无法表现出遗传物质的生命活性。只有当其存在于活细胞后,生命的特征才能充分展示出来。在分子克隆实践中,在体外操作的核酸分子只有进入细胞以后才能达到克隆的目的。一、重组DNA分子转入原核生物细胞1. 重组质粒DNA分子转化大肠杆菌转化(transf

鹌鹑PIWI基因的克隆及其结合小RNA的鉴定

PIWI 蛋白能通过与多种内源非编码小RNA结合在表观水平和转录后水平调控基因的表达。然而在家禽中,PIWI蛋白的生物学功能及其结合小RNA的作用机制尚不清楚。扬州大学动物科学与技术学院陈国宏教授课题组对该作用机理进行了研究*,研究成果发表在2012年12月刊的PLoS ONE上。PIWI 基因

基因的转移与重组体的筛选和鉴定3

2. 定向克隆使目的基因按一定的方向插入载体的克隆方案称为定向克隆。最常用的定向克隆方案使用两种限制性内切酶切割载体和目的基因,从而在载体和目的基因两端产生非同源互补的两个粘性末端。定向克隆也可以通过在一端造成平端,另一端产生同源粘性末端实现年-平连接。定向克隆有效的限制了自身环化,并且实现了目的基

血型鉴定Rh血型鉴定

Rh血型鉴定介绍: Rh血型鉴定一般指Rh系统中D抗原的检测,根据病人红细胞是否带有D抗原,分为Rh阳性和Rh阴性。Rh血型鉴定正常值: Rh血型分为Rh阳性、Rh阴性。Rh血型鉴定临床意义: (1) 我国汉族人的Rh阴性率为0.34%,绝大多数人为Rh阳性,故由Rh血型不合引起的输血反应相对较AB

间充质干细胞(MSC)如何培养与鉴定

相比于胚胎干细胞或神经干细胞,MSC具有易获取、易体外培养、传代稳定性、低免疫原性等优势,在体外经过多次传代后仍具有多向分化和自我复制的潜能,且MSCs多来自于成年的组织,研究过程的道德和伦理学问题较小。MSC的大小与形状具有异质性,即不同种属或不同组织的MSC具有不同的生长形态,例如三极形、长梭形

简述造血干细胞移植的植活鉴定

  植活标准:回输造血干细胞后,血细胞持续下降然后再回升,当中性粒细胞连续3天超过0.5×109/L,为白细胞植活;在不进行血小板输注的情况下,血小板计数连续7天大于20×109/L为血小板植活。  植活鉴定:可根据供、受者之间性别、红细胞血型和HLA的不同,分别通过细胞学和分子遗传学(FISH技术

传代细胞株体外培养、鉴定与形态观察!

在无菌条件下于健康产妇分娩后立即取新生儿脐带, 挤出脐带血管中的血液,放入装有含青链霉素的PBS液瓶中,2h之内行脐静脉内皮细胞培养。双抗:青霉素100u/ml; 链霉素100μl/mlPBS:KCl 0.2 g/L, KH2PO4 0.24 g/L, NaCl 8.0g/L, Na2HPO4•7H