12月24日《自然》杂志精选
封面故事： 2009年度新闻人物 Nature杂志2009年度新闻人物是美国总统奥巴马大胆提名的能源部部长人选朱棣文。这位曾经获得过诺贝尔奖的物理学家受命推动世界最大经济体及其能源行业的变革，以适应21世纪的需要。朱棣文曾在劳伦斯伯克利国家实验室工作4年时间，在这期间，他将该实验室重塑为替代能源研究的一个领先机构。担任能源部部长后，他也不忘将该实验室在“曼哈顿项目”中所开创的战时精神移植过来。朱棣文说，如果美国要动员其科学与技术资源应对气候变化的话，那么它将需要在上个世纪40年代推动原子弹早期研究工作的那种紧迫感。Eric Hand在哥本哈根气候会议前就这个问题及美国政府的相关计划对朱棣文进行了采访。 X射线天文观测成果综述 过去10年，X射线天文学家从现有两个在轨道上运行的X射线天文观测装置获得大量成果，这两个装置分别是美国国家航空航天局的钱德拉和欧洲航天局的XMM-Newton......阅读全文
怎样对基因组DNA质量检测
怎样对基因组DNA质量检测用凝胶电泳看,有没有质白质和RNA等物质的污染,还可以测OD,用OD260/280来判断,当OD260/OD280< 1.8,表示蛋白质含量较高当OD260/OD280> 2.0,表示RNA含量较高当OD260/OD280=1.2.0,表示DNA较纯
生物基因组DNA的种类介绍
1、蛋白编码序列。以三联体密码方式进行编码。编码DNA在基因组中所占比例随生物而异，在人类细胞基因组中，这一比例只有1.5%左右。这类编码序列主要是非重复的单一DNA序列，一般在基因组中只有一个拷贝（单一基因），然而，也有可能有两个或几个拷贝甚至多达上千个拷贝的情况，这些都来自于从基因家族里派生出来
细菌中制备基因组DNA实验
实验方法原理 提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质，再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质，得到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从溶液中析出。实验材料 细菌试剂、试剂盒 TE氯化铯溴化乙锭NaCl乙醇CTAB仪器、耗材 离心机摇床实验步骤 1
细菌基因组DNA提取方法综述
细菌基因组DNA的提取方法综述，提供了5种方法。 1 快速微量提取法A.取1.5ml菌体培养物于一灭菌Ep管中，12000rpm离心1min, 丢去上清夜，收集菌体。B.加入400ul裂解液（40mMTris-醋酸，20mM醋酸钠,1mMEDTA,1%SDS,pH7.8）混匀,置于37oC水浴1hr
真核细胞基因组DNA的提取
实验概要高等动物，高等植物的基因组相当庞大，如人类细胞基因组由30亿个碱基对组成，果蝇基因组有1.4×108个碱基对，水稻基因组有1.4×109个碱基对。真核细胞基因组中，约1万－1.5万个可表达的结构基因，其它大量存在的是调控序列和内含子序列。可以说某特定物种的基因组，包含了该物种生长，发育，繁殖
昆虫全基因组DNA的提取
实验概要利用改进的CTAB 法提取昆虫全基因组DNA。主要试剂1. 蛋白酶K[美国Merck公司]2. 三羟甲基氨基甲烷(Tris)[美国Amresco公司]3. Taq DNA聚合酶及dNTP[NEB公司]4. 琼脂糖及溴化乙锭(EB)[美国Amresco公司生产]5. 乙二胺四乙酸钠(Na2ED
基因组DNA的纯化与回收
实验概要质粒、噬菌体等经酶切，电泳；PCR产物经电泳后，常常需要对一些DNA电泳片段进行回收和纯化，用于亚克隆、探针标记、测序等。DNA回收和纯化常用方法有压碎法、低融点琼脂糖法、冻融法等，也有现成的试剂盒供应。主要试剂酚、氯仿、NaAc、无水乙醇、TE、Tris-HCl饱和酚、异丙醇、低融点琼脂糖
SDS法提取植物基因组DNA
本方法由Dellaporta,Wood和Hicks(1983)的方法修改而成。其基本原理是研磨的组织细胞用热的SDS裂解后，加入高浓度的KAc，0℃放置以除去蛋白和多糖类杂质，最后用乙醇或异丙醇沉淀。一 材料、试剂和仪器1 材料 新鲜的组织材料或-80℃冻存的材料2 试剂(1)提取缓冲液Tris-H
从动物组织提取基因组DNA
实验概要本实验以哺乳动物新鲜组织为材料，学习基因组DNA提取的一般方法。实验原理基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性，可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀
生物基因组DNA的分类介绍
1、蛋白编码序列。以三联体密码方式进行编码。编码DNA在基因组中所占比例随生物而异,在人类细胞基因组中,这一比例只有1.5%左右。这类编码序列主要是非重复的单一DNA序列,一般在基因组中只有一个拷贝（单一基因）,然而,也有可能有两个或几个拷贝甚至多达上千个拷贝的情况,这些都来自于从基因家族里派生
Nature子刊：DNA“笼子”的妙用
来自麦吉尔大学的研究人员在最新一项研究中指出，DNA链制成的纳米结构可以用于封装小分子药物，并在特定的刺激下释放药物，这一研究成果公布在9月1日的Nature Chemistry杂志上。 这项研究将有助于生物纳米结构在药物递送方面的应用，也将为设计以DNA为基础的纳米材料开辟新的道路。
Nature：DNA复制过程的关键奥秘
最近，沙特国王科技大学（King Abdullah University of Science and Technology，KAUST）的研究人员，揭开了DNA复制过程中的一个关键奥秘。相关研究结果发表在最近的国际顶级学术刊物《Nature》。 在一个细菌分裂之前，它必须通过一个称为DNA复
潘学文博士Nature解析DNA修复
生物通报道：来自贝勒医学院的研究人员指出了一种核小体重构因子：Fun30在DNA双链端粒末端切除过程中扮演的重要角色，为进一步解析DNA双链断裂修复过程提供了新思路，相关成果公布在Nature杂志上。 文章的通讯作者之一是华裔科学家潘学文博士(Xuewen Pan，生物通音译)，其早年
DNA修复技术烷基的转移过程介绍
在细胞中发现有一种O6甲基鸟嘌呤甲基转移酶，能直接将甲基从DNA链鸟嘌呤O6位上的甲基移到蛋白质的半胱氨酸残基上而修复损伤的DNA。这个酶的修复能力并不很强，但在低剂量烷化剂作用下能诱导出此酶的修复活性。
DNA印迹法实验步骤转移的相关介绍
1)取一个较大的方形瓷盘,放一块玻璃板于盘上,盘内加转移液(6×SSC或10×SSC)使液面距离玻璃底面约1,2cm,玻璃板表面盖两张预先用转移液浸润的Whatman 3M ·滤纸(也可用新华滤纸),滤纸两端浸入SSC转移液中,用一玻璃棒将滤纸压平,滤纸与玻璃板间不得有气泡, 2)将琼脂糖凝胶
分离基因组DNA和质粒DNA有哪些不同之处
分离质粒时，可以将质粒去得很干净。方法为：先用TE之类的试剂将菌液悬浮起来，再用NaOH和SDS将菌液裂解（起裂解作用的主要是NaOH，但此时，SDS可以与蛋白很好的结合）。第三步，加入酸中合第二步中的碱，并且将SDS沉淀下来，同时，SDS和蛋白也一起沉淀下来，而基因组上面有很多的蛋白，这样基因组就
提取基因组dna后，怎样判断dna的纯度和质量
用紫外分光光度计测od值a260/a280正常1.8左右如果制备的dna样品a260/a2802，说明样品中rna过高，可用rnase消化后，用酚、氯仿、异戊醇抽提，再用乙醇沉淀dna
群体基因组分析发表Nature子刊
脂肪有着顺滑的口感，香甜的味道和充足的饱腹感，很多动物对脂肪都垂涎三尺，人类也不例外。但是，我们知道摄入脂肪太多会影响心血管健康，所以对冰淇淋和油炸食品等富含脂肪的食物需要浅尝而止。可是，总有些人无论吃多少高脂肪的食物，也不会得心血管疾病。为什么呢？ 研究人员找到了罗伯塔莫斯（Mylopota
Nature－Genetics：多种技术解析草莓基因组
近日，美国密歇根州立大学和加州大学戴维斯分校的研究人员组装出近乎完整的栽培草莓基因组，并揭示了这种复杂的异源多倍体的起源和进化过程。 一转眼又到了草莓上市的季节。这种小巧可爱的果实有着酸甜可口的味道，可搭配出各种各样的美妙滋味。不过，对于草莓的基因组，你又了解多少？ 世界各地广泛种植的凤梨草
Nature子刊解码中国仓鼠基因组
在Alfred Pühler教授的领导下，来自比勒菲尔德大学生物技术中心(CeBiTec)的基因组研究人员，成功地对中国仓鼠(Chinese hamster)的基因组进行了测序。研究人员现将他们的结果发表了在国际期刊《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上。
Nature新文章解析三大基因组
发表在最新一期(12月19日)《自然》(Nature)杂志上的一篇新文章，揭示了三个重要生物――水蛭(leech)、海蠕虫(Capitella teleta)和青贝(limpet)基因组。通过这一研究，来自莱斯大学、加州大学伯克利分校和美国能源部联合基因组研究所(JGI)的科学家们将冠轮动物
Nature子刊：基因组编辑新技术
许多的实验室都在利用近期发现的一种细菌和古细菌天然防御机制作为基因组编辑工具。与真核生物的RNA干扰过程相似，这一CRISPR-Cas系统通过序列特异性切割外源核酸，保护了原核生物免受病毒攻击。而CRISPR-Cas系统有可能发生非特异性靶向，导致基因组别处突变，也引起了人们越来越多的关注。
Nature破解土壤中的耐药基因组
在美国，每年大约有两百万人受到耐药菌的感染，其中有超过两万三千人会因此而死亡。人们发现，耐药菌能够分享对抗生素的抗性，这种现象无疑进一步加重了公共健康所面临的威胁。 近日华盛顿大学医学院的科学家们解析了土壤细菌的耐药基因组（resistome）。他们发现，生活在土壤中的天然细菌拥有大
Nature发布轮虫基因组研究新成果
有一群动物放弃了性，但却在进化过程中生成了460多种物种。本周的《自然》(Nature)杂志上发表了一篇关于蛭形轮虫(bdelloid rotifer)全基因组的研究论文，为揭示这一进化机制减少了些许神秘。 Woods Hole海洋生物学实验室(MBL)David Mark Wel
Nature子刊：拨开基因组的迷雾
在人类基因组计划的早期，人们热情高涨。尽管人类基因组计划是一项耗资巨大的艰难工程，但它将在临床诊疗领域带来无法估量的回报。一旦我们获得了人类生命的蓝图，就能够揭开大量人类疾病的遗传基础，个性化诊疗将得以实现，医疗领域也将因此迎来一场革命。 至少，人们当初是这样期待着。 然而，“在人类
Nature新闻：基因组测序追踪超级病菌
研究人员通过基因组测序最终了解了去年困扰英国剑桥一家新生儿特护病房达数月之久的超级细菌疫情。他们将这一案例报告在11月14日的《柳叶刀传染病》(Lancet Infectious Disease)杂志上，标志着首次科学家们通过测序病原体基因组积极控制了一场持续爆发的疫情。 在两天内Ro
Nature－Methods发布基因组测序新工具
十月十七日Nature Methods杂志发表的一项研究显示，新测序技术与新算法的结合可以为人们揭示复杂基因组的详细信息。加州大学戴维斯分校和Pacific Biosciences公司的研究人员的FALCON-Unzip算法能够将长读取测序数据装配成高度准确、连续和正确定相的二倍体基因组。 随
－Nature：基因组研究探秘膀胱癌
日前，来自癌症基因组图谱研究网络(The Cancer Genome Atlas Research Network, TCGA)的研究人员在《自然》杂志上报告称，他们确定了一种主要的膀胱癌形式的新潜在治疗靶点，其中包括疾病中遭到破坏的一些重要基因和信号通路。 此外，他们还发现，在分子水
Nature子刊：基因组编辑终结贫血
澳大利亚新南威尔士大学的研究人员发现，改变红细胞中DNA的单个碱基，可提高它们生产携氧血红蛋白的能力。这项成果于5月14日在线发表在《Nature Communications》上，有望带来镰状细胞贫血及其他血液疾病的治疗。 研究人员利用TALENs基因组编辑技术，将一个有益的、天然存在的遗
Nature子刊：为基因组编辑保真
有时生物学很残酷，在健康和致命疾病之间，往往只有一个遗传密码的差异。尽管人们一直在研究这些微小改变引发的疾病，但在人类干细胞中对其进行重现依然颇具挑战。 现在，Gladstone研究所的科学家们开发了一个新技术，能够帮助人们对人类基因组进行有效的单碱基编辑，文章发表在近期的Nature