SILAC(StableIsotopeLabelingwithAminoAcidsinCellCultures)

2002年,丹麦Mann实验室的Ong等对AACT技术作了进一步改进,建立了SILAC技术并首次应用于定量蛋白质组研究,为全面、系统地定性和定量分析复杂哺乳动物细胞蛋白质组提供了有效的方案。原理:SILAC的基本原理是分别用天然同位素(轻型)或稳定同位素(重型)标记的必需氨基酸取代细胞培养基中相应氨基酸,细胞经5-6个倍增周期后,稳定同位素标记的氨基酸完全掺入到细胞新合成的蛋白质中替代了原有氨基酸。不同标记细胞的裂解蛋白按细胞数或蛋白量等比例混合,经分离、纯化后进行质谱鉴定。 优缺点: 1、SILAC是体内标记技术,稳定同位素标记的氨基酸与天然氨基酸化学性质基本相同,对细胞无毒性,因而它所标记的细胞和未标记细胞在生物学行为上几乎没有差异,标记效率可高达100% 2、与化学标记相比,SILAC方法蛋白需要量明显减少 3、活体标记,更接近样品真实状态 4、只适用于活体培养的细胞对于生物医学研究中常用的组......阅读全文

AACT-vs.-SILAC:-技术原创之争

  从原创文献追溯,AACT/SILAC技术的原创者应该是陈先教授(Xian Chen, Department of Biochemistry and Biophysics, University of North Carolina at Chapel Hill)。2000年,陈先教授在《Analy

中科院Nature开源性刊物发表蛋白质研究新技术

  来自中科院大连化学物理研究所的研究人员开发一种新型的同位素标记策略,可对6种不同的蛋白质样品进行可靠标记并进行同时定量。并证实这一策略适用于高通量检测蛋白质周转(turnover)动态。这一研究成果发表在国际著名刊物Nature旗下开源性刊物Scientific Reports上。   中

方案10-定量蛋白质组学的体内蛋白质同位素标记实验

实验材料酿酒酵母试剂、试剂盒丙酮乙腈NH4HCO3细胞生长培养基干冰冰水2-巯基乙醇甲醇铁氰化钾蛋白提取试剂组合蛋白酶抑制剂硫代硫酸钠仪器、耗材离心蒸发仪离心管血细胞计数器孵育器MALDI- TOF 质谱仪和 LC-MS MS 系统超声波破碎仪分光光度计实验步骤一、培养细胞二、提取蛋白的细胞准备三、

蛋白质组学几种定量方法的案例解读(二)

经典案例题目:A tumour suppressor network relying on the polyamine-hypusine axis(一种基于多胺Hypusine轴(Polyamine-hypusine axis)的新型肿瘤抑制网络)期刊:Nature主要技术:iTRAQ定量文章摘要:

赛默飞在ASMS-2012期间推出新型质谱样品制备产品

  温哥华,不列颠哥伦比亚省--2012年5月21日 - ASMS 2012 —全球科学服务领域的领导者赛默飞世尔科技,将在5月20~24日,于温哥华会展中心举办的ASMS 2012会议期间展示其几款新型质谱样品制备产品。 Thermo Scientific HiPPR去除树脂洗涤剂   

探秘人体之中的流感工厂

  也许是受全球每年300至500万严重流感病例的启发,吉尼斯世界纪录组织正在对个人或组织做广告,试图为大多数人同时上流感教育课创造纪录。与此同时,一小群人正在更为集中地尝试了解大量流感蛋白。弗莱堡大学的Andrea C. Becker以及她的德国和瑞士同事调查了A型流感病毒对三种肺源性细胞系的影响

赛默飞世尔科技:为蛋白质组学提供深层次解决方案

  定量蛋白试剂盒  在蛋白分析相关的试剂消耗品方面,Thermo Fisher Scientific都是直接在仪器上开发的。由于试剂和仪器时配套的,从而能够提高分析效率。例如细胞培养氨基酸稳定同位素标记技术(SILAC)和串联质谱标签(tandem mass tag)试剂盒。  细胞培养氨基酸稳定

蛋白质组质谱新方法一览

2003年人类基因组精细图绘制完成,是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥?因为中心法则告诉我们,基因的产物——蛋白质,是生命活动的最终执行者。与基因组类比,研究生物体内全套蛋白质的科学,就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年,人类蛋白质组计划启动,令人激动

蛋白质定量

Quantitative Determination of Peptides by Sulfhydryl (-SH) Groups New (Contributed by David Van Horn, Dept. of Chemistry, UC Berkeley Greg Bulaj, Dept

蛋白质组学几种定量方法的案例解读

   上期分享的蛋白组学内容,是不是有些小伙伴还绕在云里雾里呀?这次,小编用实例说话,帮您梳理清楚。   一、Label-free定量    Label-free定量,顾名思义就是不需要对比较样本做特定标记处理,只需要比较特定肽段/蛋白在不同样品间的色谱质谱响应信号便可得到样品间蛋白表达量的变化

定量蛋白质组学方法分类介绍

  【蛋白研究系列专题】-4丨定量蛋白质组学方法,您值得拥有   1 背景和意义    从生命活动的直接执行者——蛋白质的角度研究生命现象和规律(特别是疾病防治和病理研究)已成为研究生命科学的主要手段。而这些研究往往离不开对细胞、组织或器官中含有蛋白质种类和表达量的研究。对处不同时期、不同条件下

蛋白质定量实验

试剂、试剂盒 考马斯亮蓝 G250乙醇磷酸实验步骤 (1) 准备 100~1500 ug/ml 的标准品, 溶于 Bradford 法相兼容缓冲液中。对于较稀的样品,可能通过增加样品在试剂体积中的比率而扩大灵敏度(microBradfordassay:1~25ug/mL)。如果样品与染料的比

蛋白质定量实验

考马斯亮蓝蛋白质浓度分析法 碱性铜还原分析法 胺衍生法             实验方法原理 蛋白质分子中的芳香族氨基酸酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸残基,其化学结构中

赛默飞世尔科技“蛋白质组学解决方案”网络视频讲座

  3月30日下午,赛默飞世尔科技蛋白质组学市场专员唐佳向大家作了题为《蛋白质组学研究方法和Thermo蛋白质组学解决方案》的报告

蛋白质定量技术――iTRAQ

摘要:同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术是近年来最新开发的一种新的蛋白质组学定量研究技术,具有较好的定量效果、较高的重复性,并可对多达四种不同样本同时进行定量分析。研究人员采用iTRAQ蛋白质定量技术加速蛋白质的定量研究,当然这门新兴的工具仍然需要进一步的完善。    仅仅知道蛋白质的身

蛋白质定量实验步骤

 (1) 准备 100~1500 ug/ml 的标准品, 溶于 Bradford 法相兼容缓冲液中。对于较稀的样品,可能通过增加样品在试剂体积中的比率而扩大灵敏度(microBradfordassay:1~25ug/mL)。如果样品与染料的比值太高, 可能会增加反应混合物的 PH 而导致反应背景较高

蛋白质定量常用方法

1.基于蛋白分子中含有酪氨酸和色氨酸而使用的酚试剂比色法 由于各种蛋白质分子中上述两种氨基酸的组成比例不同,特别是白蛋白含色氨酸为0.2%,而γ-球蛋白中含量达2%-3%,导致较大的差异。Lowry的改良法在酚试剂中加入Cu2+,集中原法和双缩脲反应两者的作用,使呈色灵敏度提高。其中75%的呈色依赖

蛋白质定量常用方法

1.基于蛋白分子中含有酪氨酸和色氨酸而使用的酚试剂比色法 由于各种蛋白质分子中上述两种氨基酸的组成比例不同,特别是白蛋白含色氨酸为0.2%,而γ-球蛋白中含量达2%-3%,导致较大的差异。Lowry的改良法在酚试剂中加入Cu2+,集中原法和双缩脲反应两者的作用,使呈色灵敏度提高。其中75%的呈色依

大规模蛋白质相互作用研究方法进展(三)

           图1 TAP亲和层析纯化原理[14]  注:A:标签中的ProteinA 与固化的IgG 结合缓冲液淋洗去除不能结合的杂蛋白,TEV 酶切分离ProteinA   和靶蛋白;B:利用CBP(Calmodulin binding peptide)-Calmodulin   的相互

形形色色的蛋白标签(二)

  体内标记   对于in vivo标记,人们通常用化学标记的营养物喂养细胞,让它们掺入新合成的蛋白、核酸或代谢物。之后收获细胞,分离出这些分子,从整体上查看细胞行为,或利用抗体或其他捕获试剂来研究某个蛋白。   蛋白质组研究人员常用的方法是SILAC,即细胞培养中氨基酸的稳定同位素标记。两

质谱技术在蛋白质组研究中的分析方法

2003年人类基因组精细图绘制完成,是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥?因为中心法则告诉我们,基因的产物——蛋白质,是生命活动的最终执行者。与基因组类比,研究生物体内全套蛋白质的科学,就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年,人类蛋白质组计划启动,令人激动

定量蛋白质组学质谱采集技术进展(一)

摘要 质谱是定量蛋白组学的主要工具。近年来随着定量蛋白质组学研究的深入,传统质谱定量技术面临着复杂基质干扰、分析通量限制等诸多问题。而最近一系列质谱新技术的发展,包括同步母离子选择(SPS)、质量亏损标记、平行反应监测(PRM)、多重累积(MSX)和多种全新数据非依赖性采集(DIA)等,为解决目前蛋

定量蛋白质组学方法分类

1 背景和意义从生命活动的直接执行者——蛋白质的角度研究生命现象和规律(特别是疾病防治和病理研究)已成为研究生命科学的主要手段。而这些研究往往离不开对细胞、组织或器官中含有蛋白质种类和表达量的研究。对处不同时期、不同条件下蛋白质表达水平变化的研究,识别功能模块和路径,监控疾病的生物标志物,这些研究都

蛋白质组的同位素标记亲和标签(ICAT)技术分离介绍

  同位素亲和标签技术是一种用于蛋白质分离分析技术,此技术是蛋白质组研究技术中的核心技术之一。该技术用具有不同质量的同位素亲和标签( ICATs) 标记处于不同状态下的细胞中的半胱氨酸,利用串联质谱技术,对混合的样品进行质谱分析。来自两个样品中的同一类蛋白质会形成易于辨识比较的两个不同的峰形,能非常

定量蛋白质组学方法获得了泛素化分布和动态变化信息的介绍

泛素化是真核生物特有的翻译后修饰,在哺乳动物细胞中,泛素化靶向∼100,000 个位点,并由约640种泛素化酶和约90种去泛素化酶可逆调控。尽管目前泛素化已被广泛关注和研究,但对蛋白质特定位点的泛素化比例(占有率)进行量化的研究却很少。因此本文主要通过定量蛋白质组学方法,量化了人类细胞中蛋白质组范围

尿液蛋白质定量检测方法

  丽春红-S法  尿液标本中的蛋白质与丽春红-S染料混匀后一起被三氯醋酸沉淀,将沉淀物溶解于碱性溶液中,此时溶液呈紫色,显色深度与蛋白质浓度成正比。  试剂三氯乙酸-丽春红-S试剂原液:称取丽春红-S 1.0 g,加入到1 000 ml 300 g/L三氯乙酸中溶解。  三氯乙酸-丽春红-S试剂应

尿液蛋白质定量检测操作

  先做尿蛋白定性试验,以适当稀释标本。在试管中加入100μl标本,再加入1 ml三氯乙酸一丽春红-S应用液,混匀后以3 000 r/min离心15分钟,吸去上清液,倒置于洁净滤纸上。在沉淀中加入0.2 mol/L氢氧化钠溶液l ml,用560 nm波长测定其吸光度,查标准曲线的蛋白含量。

蛋白质的定量测定实验

试剂、试剂盒 Bradford 试剂牛血清白蛋白 (BSA) 标准溶液Tris-缓冲盐溶液仪器、耗材 微量滴定板分光光度计或酶联仪实验步骤 材料与设备牛血清白蛋白 (BSA) 标准溶液 (2 mg/ml 水溶液)Bradford 试剂(CoomassiePlus,PierceChemicalCo.)

蛋白质的定量测定实验

试剂、试剂盒Bradford 试剂牛血清白蛋白 (BSA) 标准溶液Tris-缓冲盐溶液仪器、耗材微量滴定板分光光度计或酶联仪实验步骤材料与设备牛血清白蛋白 (BSA) 标准溶液 (2 mg/ml 水溶液)Bradford 试剂(CoomassiePlus,PierceChemicalCo.)分光光

蛋白质的定量测定实验

            试剂、试剂盒 Bradford 试剂 牛血清白蛋白 (BSA) 标准溶液 Tris-缓冲盐溶液 仪器、耗材