中国汉族人群MHC遗传变异图谱完成

由安徽医科大学、复旦大学与华大基因研究院共同开展的人类MHC(主要组织相容性复合体)区域全覆盖深度测序近日完成。该研究构建出迄今为止最完整的中国汉族人群MHC遗传变异数据库(Han-MHC),并阐述了其在复杂疾病研究中的重要价值。相关成果5月23日在线发表于《自然—遗传学》。 MHC又被称作HLA(人类白细胞表面抗原),位于6号染色体上,包括一系列紧密连锁的基因座,与人类免疫系统功能密切相关,涉及几乎所有复杂疾病的发生、发展,有人称之为人类的“主要抗原”,阐明该区与疾病的关系一直是生命医学研究领域的热点和难点。 近年来,欧洲人群利用已建立的5225例来自I型糖尿病联盟的MHC区域遗传变异参考图谱,开展了众多欧洲人群复杂疾病的MHC关联性研究。由于缺乏大样本量的中国人群MHC遗传变异参考图谱,目前国内鲜有利用精细定位策略寻找MHC区域与中国人群复杂疾病相关致病性的变异研究。因此,亟待针对中国人群MHC区域展开大规模、系统性......阅读全文

《自然》发表人类遗传变异体大型数据库gnomAD

  英国《自然》杂志及其子刊27日在线发表了基因组聚集数据库(gnomAD)团队的系列研究论文,介绍了研究人员对这个大型数据库的多方面分析,其结果有助人们深入认识人类基因功能,提升对罕见和常见遗传病的理解。  基因组聚集数据库(gnomAD)是一个大规模的人类遗传变异体数据库,汇集了来自不同人群的外

科学家绘制番茄群体级别表观遗传变异图谱

海南大学三亚南繁研究院/热带作物学院教授王守创团队绘制出首个番茄的群体级别表观遗传变异图谱。通过研究,他们发现,在番茄育种历史过程中,群体DNA甲基化在多个维度上发生了巨大变异。相关研究为番茄遗传改良和新品种培育提供重要的源头数据,也为深刻认识植物代谢多样性的分子和遗传基础提供了理论参考。近日,相关

“重测序”寻找高粱遗传变异-助力粮食作物育种改良

  2013年8月28日,来自澳大利亚昆士兰大学、深圳华大基因研究院等单位的科研人员对一重要粮食饲料作物--高粱进行了全基因组测序及分析。该研究比较了44个高粱品种的基因组序列,发现高粱基因组中存在大量的遗传变异,为今后高粱及其它粮食作物的育种改良提供了宝贵的遗传资源,同时也为解决全球日益

常见遗传变异决定自闭症大部分遗传风险

  在很多家族中常见的遗传变异决定了自闭症的大部分遗传风险,这是在线发表于《自然—遗传学》上的一项研究给出的结论。这将有助对自闭症谱系障碍(ASD)的遗传学原理的进一步研究。  最近有关ASD遗传结构的一些研究并不认为罕见遗传变异和常见遗传变异在与ASD的相关性上有什么区别。  Joseph Bux

中大绘出广东食管鳞状细胞癌遗传变异图谱

  由中山大学肿瘤防治中心贾卫华教授领衔,中山大学、美国NIH等多家机构的科研人员组成的国际合作团队,基于新一代测序技术、基因的表达谱分析、体内外实验以及大量临床数据,对食管鳞状细胞癌的全基因组变异进行了历时五年的研究,绘制出广东食管鳞状细胞遗传变异图谱。  广东是食管癌高发大省,人群具有独特的遗传

Nature-Genetics:中国人群MHC遗传变异图谱完成

  5月23日,国际著名杂志《Nature Genetics》(自然遗传)以论著的形式在线全文发表了安徽医科大学、复旦大学与华大基因共同完成的人类MHC(major histocompatibility complex)区域全覆盖深度测序的研究成果,该研究成功构建出迄今为止最完整的中国汉族

新型药物可治疗由有害遗传变异导致的心脏疾病

  b-阻断剂是世界上常用的治疗心血管疾病的药物,例如心律失常或心脏衰竭等等。几十年来,科学家们已经知道了b-阻断剂能够用于降低心率以及收缩力,从而起到放松心压的目的。然而,最近一项由纽约大学研究者们做出的工作则表明,这些药物同时能够缓解一系列由于遗传变异引发的心脏疾病。  利用心脏衰竭模型以及下一

“动物流感遗传变异与致病机理研究”等项目启动

   10月12日,科技部农村中心在哈尔滨组织召开了国家重点研发计划 “畜禽重大疫病防控与高效安全养殖综合技术研发”专项下属“动物流感遗传变异与致病机理研究”、“家禽重要疫病诊断与检测新技术研究”两个项目的启动会。科技部农村中心、中国农业科学院、黑龙江省科技厅、哈尔滨市科技局管理人员以及项目咨询专家

Lancet子刊!额颞叶变性与这些遗传变异有关!

  额颞叶变性(FTLD)是以大脑局限性额叶和颞叶变性萎缩为特征的中枢神经系统退行性疾病,是一组多发生于老年前期(45-65岁)的痴呆综合征。  FTLD患者皆存在TAR-DNA结合蛋白43(TDP-43,一种调节转录的核蛋白)的异常磷酸化,GRN基因突变是FTLD的常见遗传因素,但不同患者发病年龄

生命如何变复杂:饥饿可导致酵母菌遗传变异

  据物理学家组织网站报道,当天体生物学家们思考其他行星或卫星上存在生命的可能性时,他们一般假定的都是简单的生命体。比如针对木星的卫星木卫二,当科学家们在那里尝试搜寻生命时,他们的目标并非复杂的生命体,而是类似细菌那样最简单的生命形式。  但是在简单生命的基础上,复杂生命形式迟早都会发生,而这正是在

《自然》:近4千种遗传变异与吸烟或饮酒有关

中新网北京12月8日电 (记者 孙自法)国际著名学术期刊《自然》最新发表一项篇遗传学研究论文称,在一项涉及近340万人的多血统全基因组关联研究(GWAS)中,研究人员发现了近4000个与吸烟和饮酒行为的遗传关联。这项发现对这些复杂行为的潜在遗传影响提供了见解。 该论文介绍,吸烟和饮酒是多种疾病和紊乱

Cell:构建人类免疫细胞图谱,确定遗传变异对基因影响

  比较任何两个人的DNA,你会发现他们的遗传密码中的数百万个位点存在着不同。如今,在一项新的研究中,来自美国拉霍亚免疫学研究所(LJI)的研究人员分享了大量数据,这些数据对于破译这种自然遗传变异如何影响免疫系统保护我们健康的能力至关重要。相关研究结果于2018年11月15日在线发表在Cell期刊上

不一样的疾病,一样的遗传变异

  在分析基因与性状之间的关联时,人们往往采用全基因组关联研究(GWAS)。不过,纽约基因组中心和23andMe的研究人员似乎并不满足于GWAS分析。他们收集了大规模研究中研究过的所有性状,想看看这些看似无关的性状之间是否存在关联。他们果然有收获,还发表在《Nature Genetics》上。  “

全球最大人胚胎干细胞遗传变异研究结果发布

健康所参与的全球最大人胚胎干细胞遗传变异研究结果发布  在国际干细胞研究组织(International Stem Cell Initiative, ISCI)倡导下,来自中国、英国、新加坡、伊朗、美国、以色列、瑞士、瑞典、韩国、澳大利亚、捷克、巴西、印度、日本、俄罗斯、比利时、加拿大、荷兰和芬

英国科学家发现7种疾病的新遗传变异体

该研究为开发新的治疗措施和进行遗传测试铺平了道路  英国科学家最近在了解疾病背后的遗传学因素方面取得了重要进展。为了寻找遗传差异,研究人员分析了17000人的血样脱氧核糖核酸(DNA),最终发现了双相障碍、克罗恩病、冠心病、高血压、风湿性关节炎和1型与2型糖尿病的新遗传变异体。该研究结果为开发新的治

张德强团队系统解析多基因控制林木表型遗传变异

  近日,北京林业大学教授张德强团队依托“973”课题与教育部引智计划项目,在前期对控制木材形成重要候选基因内等位变异关联作图研究的基础上,首次系统解析了生物学途径上多个关键基因联合控制林木生长与品质性状的遗传变异。  林木重要经济性状的遗传调控机制十分复杂,由加性、显性与上位性遗传效应协同作用。如

新研究发现49个容易导致静脉曲张的遗传变异

  静脉曲张是慢性静脉疾病的一种常见的表现形式,影响全球约30%的人口,多见于40至80岁人群。在我国,就有约2亿患者。静脉曲张如果不加以治疗,会发展为多种并发症,包括腿部溃疡、血管破裂等,严重者可能导致截肢,甚至危及生命。目前的针对静脉曲张的健康管理包括弹力袜或对更严重患者的手术消融。大多数静脉曲

人类基因遗传变异整合图谱完成华大基因承担1/4工作

  11月1日,由中、美、英等多个国家共同发起的大型国际合作项目“千人基因组计划”的最新研究成果在国际著名科技期刊《自然》杂志上在线发表。该协作组公布了高分辨率的人类基因组遗传变异整合图谱,将为基因组学在人类疾病与健康领域中的应用以及个体化医疗时代的到来奠定坚实的科学基础。华大基因作为该计划的发起者

新研究构建出小麦属全基因组遗传变异图谱

  小麦是人类历史上最成功的作物之一,它起源于新月沃地一个狭小的核心区域,一万年间,从地区性的野生植物迅速转变成为全球种植面积最广的作物之一,在多种多样的环境下为人类提供大量的碳水化合物和蛋白质。然而,小麦对自然环境和人类粮食需求两方面同时适应的遗传机制尚不清楚,理解小麦适应性进化对气候变化条件下小

迄今为止荔枝最全面的遗传变异图谱构建成功

  近日,广东省农业科学院果树研究所研究员欧良喜团队与华南农业大学教授夏瑞团队合作,在荔枝资源群体遗传和果实性状形成研究方面取得重要进展,成功构建了迄今为止荔枝(乃至整个无患子科)最全面的遗传变异图谱。相关成果发表于《基因组生物学》(Genome Biology)。  研究团队在国家荔枝龙眼产业技术

科学家发现海量的遗传变异“淹没了”肿瘤治疗之效

  肿瘤内部异质性是癌症产生抗药性、转移性的主要原因。肿瘤发生是体细胞演化的过程,正如自然群体多样性一样,随机突变和自然选择是肿瘤内部异质性的主要进化动力。日本遗传学家木村资生指出,大量的遗传多样性无法仅用达尔文自然选择解释,继而他提出中性进化理论或非达尔文进化过程。虽然癌症生物学领域内达尔文进化过

北京生科院揭示RNA结合蛋白调控网络中功能遗传变异的机制

  绝大部分遗传变异(尤其是同义突变)或RNA编辑并不会引起蛋白结构的改变,因此,这些遗传变异或RNA编辑是如何影响生物表型的尚不清楚。RiboSNitches是可以改变RNA结构的单核苷酸变异体(SNVs),它的丢失可能会导致特定RNA结构的改变,这种现象发生在成千上万的区域位点,其中包括3'-U

抑郁根源或是基因-抑郁症高度相关的遗传变异被确定

  本周英国《自然》杂志16日公开的遗传学论文上,中英科学家们确定了两个和重度抑郁症高度相关的遗传变异。重度抑郁症是一种特别严重且极易复发的抑郁症形式,而今的这一结果能帮助我们提高对这种复杂且常见的精神障碍疾病发病原因的认识。  抑郁症对人类健康构成严重威胁。严格上来讲,抑郁症病因迄今仍不清楚,因为

迄今为止荔枝最全面的遗传变异图谱构建成功

近日,广东省农业科学院果树研究所研究员欧良喜团队与华南农业大学教授夏瑞团队合作,在荔枝资源群体遗传和果实性状形成研究方面取得重要进展,成功构建了迄今为止荔枝(乃至整个无患子科)最全面的遗传变异图谱。相关成果发表于《基因组生物学》(Genome Biology)。研究团队在国家荔枝龙眼产业技术体系荔枝

超级泛基因组助水稻种质资源遗传变异挖掘利用

 水稻泛NLRs家族基因的共线性位点(左);基于全基因组SNPs的水稻系统发生树(右)。中国农科院供图 近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所与国内多家高校、科研单位合作,组装了251份高质量的水稻基因组,构建了目前植物中群体规模最大、基因组充分注释、稻属中最为系统的超级泛基因组。该图谱

Brain:遗传变异与精神分裂症的分子机制联系

  精神分裂症(Schizophrenia)是一组病因未明的慢性精神疾病,临床上往往表现为症状各异的综合征,涉及感知觉、思维、情感和行为等多方面的障碍以及精神活动的不协调。基于双生子的遗传学研究显示精神分裂症遗传率约79~81%,表明遗传因素在精神分裂症中具有重要作用。  目前,国际上已开展一系列大

遗传变异,或可以保护一些人免受致命MRSA伤害

  已知耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)菌血症的严重程度和持续时间在个体之间差异很大。尽管遗传关联研究已开始识别具有潜在影响的变异,但对易患持续性MRSA菌血症的宿主因素知之甚少。  9月16日,发表在《美国国家科学院院刊(PNAS)》上的一项研究中,来自美国杜克大学医学院的研究团队发现,遗传倾

2000例早发性乳腺癌患者预后相关遗传变异调查研究

  我国女性每10人中就有1人患乳腺癌,中国乳腺癌发病率增长速度正以迅雷不及掩耳之势蹿升全球第一,超世界平均增速两倍以上。相比欧美国家,中国乳腺癌患者发病年龄普遍提前10年左右,40岁下发病的患者人数占比数量也高。有研究表明,15-39岁被诊断为乳腺癌的患者,比年长患者的5年生存率低。  这种差异的

丹麦Ⅱ型糖尿病新发现-与一种遗传变异有关

  英国《自然》杂志在线版近日公布的一项研究表明,丹麦遗传学家辨别出了一种遗传变异,正是其增加了调查对象格陵兰岛人罹患Ⅱ型糖尿病的风险。这个存在于17%的研究对象当中的基因变异,会导致餐后血糖调节能力的退化。这种常见的变异对于患Ⅱ型糖尿病风险的影响,远超先前发现的与Ⅱ型糖尿病相关的基因突变。  格陵

脑细胞类型中增强子遗传变异或预测精神/神经疾病风险

  可能有人认为,大多数遗传相关疾病的主要原因来自编码DNA的突变---基因组编码区域的改变可以直接导致对健康人体重要的特定蛋白的表达发生变化。但是,人类DNA的大部分是非编码DNA,即不直接翻译成功能性蛋白的DNA区域。这些非编码DNA区域包含称为增强子的调节性序列元件,这些序列元件可以改变特定蛋