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QRTPCR

Comparison of normalisation methodsThere is an ongoing debate what is the best way to normalise qPCR data. Reference genes are the most common method, although single unverified reference genes invalidate the qPCR data generated. Total RNA, ribosomal RNA, and genomic DNA have been suggested as alternative methods.Reference genesMost common method. Frequently, a panel is used for normalization, e.g. [1]......阅读全文

控制基因敲除法

【探针技术用于检测由siRNA介导的基因调制】 为了研究基因功能,科学家们常常会有针对性地关断某些特定的基因。 而要验证这种基因沉默的有效性, 就需要运用适当的具特异性的检测方法。理想的检测方法不仅要测量准确, 而且还要能让细胞保持完好无损。   利用诸如RNA(核

siRNAs结合生物芯片的实验设计-2

Figure 2. Silencer ™ siRNA Validation Data Generated Using Applied Biosystems TaqMan® Gene Expression Assays. The indicated Silencer Validated siRNAs

实时荧光定量PCR技术-2

qRT-PCR基因表达分析在384孔板上11ul/孔的总反应体积中,使用荧光Universal ProbeLibrary(UPL)探针(罗氏公司)和ABI 7900HT 实时仪器(美国应用生物系统公司)以及2X FastStart Universal Probe Master (Rox)PCR试剂(

一种无酚/无氯仿组织研磨从热带木本植物中提...(一)

一种无酚/无氯仿组织研磨从热带木本植物中提取核酸的方法概述:木本热带植物中含有大量复杂的有机化合物,这些有机化合物会抑制提取RNA或DNA所需的化学程序,从而不利于后续研究及应用,如RNA测序和基因表达分析。为了克服这个问题,研究人员必须使用CTAB / PVP缓冲液的提取方案,而不能使用市售的

新冠样本准确度达91.4% 陈德喜团队提出基于mNGS的新方法

  在大多数严重的急性呼吸道感染病例中,RNA病毒是主要病原体,如2019年12月以来的新冠病毒(SARS-CoV-2),已导致全球超过400万人感染,超过30万名患者死亡[1,2]。mNGS因无需培养、不依赖核酸序列、无偏好广覆盖的优点,在临床疑似新发病原体、罕见病原感染、急危重症、未知原因发热等

雄激素受体通过上调ADAR1抑制circRNA表达,促进肝细胞癌

浙江大学医学院附属邵逸夫医院蔡秀军教授在腹部外科、肝胆胰外科、微创外科、移植外科等研究方面有丰富的经验,近期其团队利用Arraystar circRNA芯片研究了肝细胞癌(HCC)中雄激素受体(AR)对circRNA表达的影响。研究发现AR可以结合到RNA编辑酶ADAR1的启动子区上调ADAR1

锐博生物:环状RNA研究的方法及功能作用介绍

  锐博生物:环状RNA—隐秘的未知RNA平行宇宙   环状RNA,被喻是隐秘的未知RNA平行宇宙。最近,复旦大学的郑秋鹏博士(2016交流会嘉宾之一)以第一作者身份在Nature Communications上发布了他们关于circHIPK3的最新研究成果。现在就和小编一起来学习circRNA的

APT文献 | 蛋白质组学揭示植物干旱胁迫的分子机制

  Significant and unique changes in phosphorylation levels of four leaf phosphoproteins in two apple rootstock genotypes under drought stress.   干旱胁

芥菜型油菜种皮转录组De Novo拼接及类黄酮生物合成基因

   芥菜型油菜作为一种广泛种植的作物,能产生不同颜色的种子。种子的着色是由于内皮细胞原花色素(proanthocyanidins,PA)的沉积,该终产物是通过一条类黄酮化合物合成的途径形成。为了进一步了解芥菜型油菜种子着色的基因信号网络,研究者采用Illumina/Solexa测序平台检测近交系黄

雄激素受体通过上调ADAR1抑制circRNA表达,促进肝细胞癌

浙江大学医学院附属邵逸夫医院蔡秀军教授在腹部外科、肝胆胰外科、微创外科、移植外科等研究方面有丰富的经验,近期其团队利用Arraystar circRNA芯片研究了肝细胞癌(HCC)中雄激素受体(AR)对circRNA表达的影响。研究发现AR可以结合到RNA编辑酶ADAR1的启动子区上调ADAR1 p

雄激素受体通过上调ADAR1抑制circRNA表达,促进肝细胞癌

   浙江大学医学院附属邵逸夫医院蔡秀军教授在腹部外科、肝胆胰外科、微创外科、移植外科等研究方面有丰富的经验,近期其团队利用Arraystar circRNA芯片研究了肝细胞癌(HCC)中雄激素受体(AR)对circRNA表达的影响。研究发现AR可以结合到RNA编辑酶ADAR1的启动子区上调ADAR

蛋白质组学揭示植物干旱胁迫的分子机制

 Significant and unique changes in phosphorylation levels of four leaf phosphoproteins in two apple rootstock genotypes under drought stress.

锐博生物:环状RNA研究的方法及功能作用介绍

  锐博生物:环状RNA—隐秘的未知RNA平行宇宙   环状RNA,被喻是隐秘的未知RNA平行宇宙。最近,复旦大学的郑秋鹏博士(2016交流会嘉宾之一)以第一作者身份在Nature Communications上发布了他们关于circHIPK3的最新研究成果。现在就和小编一起来学习circRNA的

lncRNA通过调控CD56参与自然杀伤细胞发育过程

   自然杀伤(NK)细胞是一类先天性免疫淋巴细胞,与体外病毒感染和免疫调节有关。但是,lncRNA在NK细胞生物学过程中的作用还不是很清楚。研究人员借助于高通量lncRNA芯片检测技术,分析了NK细胞中lncRNA表达模式,发现了调控NK细胞分化和生物学功能相关的lncRNAs。其中,lnc-CD

lncRNA通过调控CD56参与自然杀伤细胞发育过程

   自然杀伤(NK)细胞是一类先天性免疫淋巴细胞,与体外病毒感染和免疫调节有关。但是,lncRNA在NK细胞生物学过程中的作用还不是很清楚。研究人员借助于高通量lncRNA芯片检测技术,分析了NK细胞中lncRNA表达模式,发现了调控NK细胞分化和生物学功能相关的lncRNAs。其中,lnc-CD

芥菜型油菜种皮转录组De Novo拼接及类黄酮生物...(二)

COG分类:将49,758个能比对到 Nr蛋白数据库的基因进行COG分类,结果显示25,140个基因聚成25种功能组。其中最大的COG分类组为信号转导机制组(10,471个基因大约占41.6%),详见Figure 5。Figure 5. COG function classification of

lncRNA通过调控CD56参与自然杀伤细胞发育过程

   自然杀伤(NK)细胞是一类先天性免疫淋巴细胞,与体外病毒感染和免疫调节有关。但是,lncRNA在NK细胞生物学过程中的作用还不是很清楚。研究人员借助于高通量lncRNA芯片检测技术,分析了NK细胞中lncRNA表达模式,发现了调控NK细胞分化和生物学功能相关的lncRNAs。其中,lnc-CD

环状RNA研究的方法及功能作用(一)

环状RNA—隐秘的未知RNA平行宇宙环状RNA,被喻是隐秘的未知RNA平行宇宙。最近,复旦大学的郑秋鹏博士(2016交流会嘉宾之一)以第一作者身份在Nature Communications上发布了他们关于circHIPK3的最新研究成果。现在就和小编一起来学习circRNA的研究思路,认识圆圈重塑

蛋白质组学揭示油菜卷叶机理(二)

     图4. 差异表达蛋白的COG注释分析                 

APT文献 | 蛋白质组学揭示植物干旱胁迫的分子机制

   Significant and unique changes in phosphorylation levels of four leaf phosphoproteins in two apple rootstock genotypes under drought stress.   干旱

lncRNA通过调控CD56参与自然杀伤细胞发育过程

自然杀伤(NK)细胞是一类先天性免疫淋巴细胞,与体外病毒感染和免疫调节有关。但是,lncRNA在NK细胞生物学过程中的作用还不是很清楚。研究人员借助于高通量lncRNA芯片检测技术,分析了NK细胞中lncRNA表达模式,发现了调控NK细胞分化和生物学功能相关的lncRNAs。其中,lnc-CD56,

中科院:海洋生物cDNA分析

  造礁石珊瑚为珊瑚礁生态系统中的框架生物, 研究其重要功能基因对于理解造礁石珊瑚对环境变化的响应有重要指示意义,近期来自中国科学院南海海洋研究所的研究人员提取了澄黄滨珊瑚(Porites lutea)的总RNA, 通过RT-RCR得到 cDNA, 并以 cDNA为模板设计引物进行 test

安捷伦科技发布新一代实时定量PCR试剂盒

具有更好的检测和定量能力   2010年2月24日,北京——安捷伦科技公司(NYSA:A)今天发布了Brilliant III Ultra-Fast QPCR / QRT-PCR Master Mix试剂盒,能够显著缩短循环时间和提高灵敏度,并且不影响核酸定量的准确性和重现性。   Bril

GEN:miRNA检测行业热度不减

  MicroRNAs (miRNAs)是一种存在于真核生物的内源性非编码小RNA,具有抑制靶向mRNA转录、翻译或者剪切靶向mRNA并促使其降解的功能。它会组装进入沉默复合体(RISC),识别并与靶向mRNA互补配对,从而降解或者阻止mRNA翻译。  miRNAs负责调控多种生理过程,包括细胞周期

lncRNA通过调控CD56参与自然杀伤细胞发育过程

   自然杀伤(NK)细胞是一类先天性免疫淋巴细胞,与体外病毒感染和免疫调节有关。但是,lncRNA在NK细胞生物学过程中的作用还不是很清楚。研究人员借助于高通量lncRNA芯片检测技术,分析了NK细胞中lncRNA表达模式,发现了调控NK细胞分化和生物学功能相关的lncRNAs

中科院最新文章:海洋生物cDNA分析

  造礁石珊瑚为珊瑚礁生态系统中的框架生物, 研究其重要功能基因对于理解造礁石珊瑚对环境变化的响应有重要指示意义,近期来自中国科学院南海海洋研究所的研究人员提取了澄黄滨珊瑚(Porites lutea)的总RNA, 通过RT-RCR得到 cDNA, 并以 cDNA为模板设计引物进行 test

汪建:破解疫情困局,精准检测与诊断同等重要

  我是华大基因汪建。一名亲历03年非典疫情的老兵,当年我们在国内最早完成SARS病毒测序、最先研制出诊断试剂盒,我本人还担任过北京SARS病原组组长;  这次疫情,我们在临床上最先给出了新型冠状病毒的正确诊断、最早被国家卫健委指定为第三方检验机构、首批获得国家药监局应急审批的病毒测序和诊断试剂注册

circRNA研究揭示矽肺炎症和肺纤维化的干预靶点

东南大学医学院巢杰教授课题组主要研究方向为肺炎和肺纤维化的机理机制的研究。该课题组利用Arraystar CircRNA芯片研究发现circRNA circHECTD1通过HECTD1/ZC3H12A依赖的泛素化介导SiO2诱导的矽肺中巨噬细胞活化,释放相关炎性因子和纤维化因子,继而影响矽

miRNA影响椎间盘退变的机制研究进展

  在当今社会,腰痛(LBP)患者数量庞大,LBP患者也因此饱受病痛折磨,椎间盘退变(IDD)作为LBP的最主要病因,其发病机制十分复杂,目前已知的就有基因、年龄和包括职业因素、吸烟、酗酒在内的一些不良生活习惯等因素。据统计,作为腰痛的主要病因的IDD疾病一年会给全球的经济造成超过700亿欧元的损失

lncRNAi方法通过靶向多个OncomiRs来实现HCC的肿瘤精准治疗

  一箭N雕,lncRNAi实现肿瘤精准治疗   由于引起肿瘤的发生是一个复杂的网络,因此,是否可以通过一次靶向多个OncomiR进行肿瘤治疗呢?今天,小编通过一篇发表在《Molecular Cancer Therapeutics》上的研究,来看看科学家们怎么使用lncRNAi的方法,通过靶向多个