Nature子刊:解决肿瘤异质性的革命性技术
精准医疗是指与患者分子生物病理学特征相匹配的个体化诊断和治疗策略,被认为是继经验医学、循证医学之后的第三次医学革命。作为一种极为复杂的致命疾病,肿瘤是精准医疗最重要的领域之一。 肿瘤的精准医疗需要我们准确认识患者肿瘤的分子图谱。虽然人们已经拥有了强大的遗传学分析技术(比如二代测序NGS),但肿瘤样本的异质性大大限制了这些技术的分析结果。众所周知,活检组织样本是正常细胞与肿瘤细胞的混合物,肿瘤细胞之间也存在很大的差异。 前不久Scientific Reports杂志发表的一项研究,为人们展示了能够解决肿瘤异质性的一种革命性技术。这种方法能从FFPE样本(甲醛固定石蜡包埋)中分离100%纯的肿瘤和基质细胞群。研究人员将其与下游的二代测序结合,实现了空前准确的肿瘤遗传学分析。 目前人们主要通过激光捕获显微切割、FACS分选来应对样本异质性。不过这些技术的准确性和纯度往往达不到临床使用的需求,而且受到样本大小和样本质量的限制。......阅读全文
转移性结直肠癌患者抗EGFR单克隆抗体获得性耐药异质性
尽管RAS-BRAF野生型及HER2/MET阴性转移性结直肠癌患者通常对抗EGFR单克隆抗体有反应,但获得性耐药几乎无法避免。EGFR阻滞剂耐药的机制包括KRAS、NRAS和EGFR胞外区突变以及HER2/MET改变。但是,分子异质性如何影响患者克隆演变尚不清楚。CLIN CANCER RES近
研究人员揭示肿瘤代谢抑制剂个性化治疗策略
近10年来,靶向肿瘤代谢异常成为抗肿瘤新药研发领域备受关注的研究方向之一。当前,针对十余个代谢酶靶点的数十个小分子抑制剂正处在临床前和临床研究中。其中,靶向异柠檬酸脱氢酶(Isocitrate dehydrogenase,IDH)突变的抑制剂已经分别于2017年和2019年被美国FDA批准用于携
一种简单有效的降低-RNA-3'端异质性的转录方法
实验材料 8umol L 顶链 8umol L 底链5'末端 2 个核苻酸进行甲氧基修饰试剂、试剂盒 20X 缓冲液 NTP 混合物 lmol LNaOH 聚乙二醇 8000 0.5mol LMgCl2 1mol L 谷氨酸钠 T7RNA 聚合酶 载样缓冲液实验步骤 一材料与设备1)8umol/L
一种简单有效的降低-RNA-3'端异质性的转录方法
实验材料 8umol L 顶链 8umol L 底链 5'末端 2 个核苻酸进行甲氧基修饰 试剂、试剂盒
阿尔兹海默氏症或许是一种异质性疾病
大脑中β淀粉样蛋白的积累可以损伤阿尔兹海默氏症患者的记忆及认知能力,近日刊登于国际杂志Nature Communications上的一项研究论文中,来自瑞典隆德大学的研究人员通过研究发现,阿尔兹海默氏症患者大脑中引发β淀粉样蛋白病理学表现的原因或许要远比我们认为的要复杂,研究者认为这项研究或可帮
科学家揭示水稻根单细胞异质性和分化全景图
中国科学院分子植物科学卓越创新中心王佳伟研究组系统揭示了水稻根单细胞异质性,描绘了水稻根表皮细胞和基本组织细胞的分化轨迹,明确了在根尖干细胞分化过程中基因表达与基因染色质可及性的相关性,并同时阐明了单子叶植物水稻和双子叶植物拟南芥在根尖细胞类型上的进化保守性。该研究成果4月6日在线发表于《自然—
单细胞western-blot解析乳腺癌发生过程的细胞异质性
乳腺癌起源于乳腺上皮细胞,原因是乳腺上皮细胞发生基因改变,导致随后组织稳态丧失。科学家们经过大量研究将乳腺上皮细胞分为几个不同的亚群,但依然无法完全了解上皮细胞异质性和分化谱。 加州大学欧文分校(University of California, Irvine)的科学家,在最新一期Na
灌流细胞培养对降低偶联融合蛋白裁剪和质量异质性的...
灌流细胞培养对降低偶联融合蛋白裁剪和质量异质性的作用灌流细胞培养可降低偶联融合蛋白裁剪和质量异质性来自瑞士Merck Biopharma和苏黎世联邦理工学院的科学家们在2019年第302期的《Journal of Biotechnology》杂志上发表了题为“Perfusion cell cul
植物所揭示个体差异和景观异质性对物种共存的影响
物种共存和生物多样性维持机制是生态学研究的核心问题之一。当代物种共存理论将物种共存的机制归结为形成生态位差异的稳定化机制(Stabilizing)和减少平均适合度差异的均等化机制(Equalizing)。已有研究证实了个体差异和生境异质性在决定物种间竞争结果方面的重要性,空间竞争理论的最新进展认
肝癌治疗的药敏分子分型和耐药新机制获揭示
原发性肝癌在全球癌症的致死性病例中排第三位,中国是高发国家,超过半数的死亡病例发生在中国。由于其广泛的肿瘤异质性,最新的靶向联合免疫治疗的方案仅对20%~30%的患者有效,并且缺乏指导精准用药的药敏分子分型,亟需研究可以指导肝癌精准用药的分子分型和揭示新的耐药靶点。 近日,北京大学第一医院张宁
上海药物所揭示肿瘤代谢抑制剂个性化治疗策略
近10年来,靶向肿瘤代谢异常成为抗肿瘤新药研发领域备受关注的研究方向之一。当前,针对十余个代谢酶靶点的数十个小分子抑制剂正处在临床前和临床研究中。其中,靶向异柠檬酸脱氢酶(Isocitrate dehydrogenase,IDH)突变的抑制剂已经分别于2017年和2019年被美国FDA批准用于携
上海药物所研究揭示肿瘤代谢抑制剂个性化治疗策略
近10年来,靶向肿瘤代谢异常成为抗肿瘤新药研发领域备受关注的研究方向之一。当前,针对十余个代谢酶靶点的数十个小分子抑制剂正处在临床前和临床研究中。其中,靶向异柠檬酸脱氢酶(Isocitrate dehydrogenase,IDH)突变的抑制剂已经分别于2017年和2019年被美国FDA批准用于携
肿瘤标志物高是否就有肿瘤?
肿瘤标志物是指在肿瘤发生和增殖的过程中,由肿瘤细胞合成、释放或者是机体对肿瘤细胞反应而产生的一类物质。当机体发生肿瘤时,血液、细胞、组织或体液中的某些肿瘤标记物就可能会相应的升高。通过肿瘤标志物的检查可以在肿瘤普查中早期发现肿瘤病人,帮助观察抗肿瘤治疗疗效以及判断预后。
研究成功抑制肿瘤血管、阻止肿瘤生长
美国国立卫生研究院(National Institutes of Health)和其他机构的科学家设计了一种新策略,以阻止肿瘤生长所需的新血管。曾经被认为是极有希望的癌症治疗手段--阻断刺激新的血管生长(血管生成)的分子已被证明无效,因为肿瘤细胞的反应会产生更多的刺激分子。新的策略包括使关键的酶
肝癌治疗的药敏分子分型和耐药新机制获揭示
原发性肝癌在全球癌症的致死性病例中排第三位,中国是高发国家,超过半数的死亡病例发生在中国。由于其广泛的肿瘤异质性,最新的靶向联合免疫治疗的方案仅对20%~30%的患者有效,并且缺乏指导精准用药的药敏分子分型,亟需研究可以指导肝癌精准用药的分子分型和揭示新的耐药靶点。该研究的方案及意义。(课题组供图)
高通量单细胞ChIPseq确定了乳腺癌染色质状态的异质性
近日,法国巴黎文理研究大学等科研人员在Nature Genetics上发表了题为“High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer”的文章,利用高通
“基础科学学者奖”花落中国学者
近日,第45届美国圣安东尼奥乳腺癌大会在美召开,复旦大学附属肿瘤医院乳腺外科主任邵志敏教授、江一舟教授领衔开展的一项三阴性乳腺癌基础转化研究入选本次大会的主题报告,这是今年中国大陆地区唯一一个全体大会主题报告。 会上,复旦大学附属肿瘤医院乳腺外科教授喻三见为现场万余名学者做了题为《ZNF689缺
Nat-Commun:一种鉴别恶性肿瘤的新型诊断技术
日前,一项刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中,来自瑞典卡罗琳学院等机构的科学家们通过研究开发了一种新型廉价的方法来识别趋于恶性的高度异质性肿瘤,这类肿瘤或许需要进行积极性地治疗和应对。图片来源:CC0 Public Domain 癌细胞的常见特性就是染色体或
Nature子刊-|-为食管鳞状细胞癌治疗提供新的见解
食管鳞状细胞癌(ESCC)治疗选择有限,研究表明,具有高BRCA1 / 2特征负荷的肿瘤对胰腺癌和乳腺癌中的铂疗法更敏感,这提出了ESCC中类似的突变模式可能有助于治疗不能手术的患者。此外,基于基因组学数据选择药物已经在个性化和靶向治疗的早期研究中产生了有希望的结果。一些靶向药物已用于ESCC,
昆明动物所成功揭示泛肿瘤存在基因表达紊乱共有模式
挖掘肿瘤大数据有助于识别和总结肿瘤发生、发展过程的分子变化规律。然而,肿瘤组织高度异质性、批次效应等因素是肿瘤数据分析的重要难题,而目前常用的转录组数据分析方法对于肿瘤离群值极度敏感,容易产生假阴性结果。针对此,中国科学院昆明动物研究所科研人员开发了一种新的不依赖均一化、非参的高维大数据分析算法
昆明动物所成功揭示泛肿瘤存在基因表达紊乱共有模式
挖掘肿瘤大数据有助于识别和总结肿瘤发生、发展过程的分子变化规律。然而,肿瘤组织高度异质性、批次效应等因素是肿瘤数据分析的重要难题,而目前常用的转录组数据分析方法对于肿瘤离群值极度敏感,容易产生假阴性结果。针对此,中国科学院昆明动物研究所科研人员开发了一种新的不依赖均一化、非参的高维大数据分析算法
广州生物院急性B淋系白血病细胞异质性研究取得进展
9月21日,中国科学院广州生物医药与健康研究院李鹏研究组与厦门大学附属第一医院血液科徐兵科室共同在国际学术期刊《血液学与肿瘤学》(Journal of Hematology & Oncology)杂志上发表题为Heterogeneity of CD34 and CD38 expression
研究人员揭示超级增强子动态甲基化调控转录异质性
CpG DNA甲基化早在70年代就被提出是一种用来控制基因表达的DNA化学修饰,而我们对DNA甲基化在基因组不同区域的具体功能,在疾病、发育过程中所扮演的具体角色,以及控制基因表达的详细机理,直到今天并没有全面详细的认知。 2019年8月15日,美国Whitehead研究所Rudolf Jae
新研究揭示喀斯特地区土壤水分格局的空间异质性
土壤水分的时间、空间格局是许多陆地生态系统土壤水分状况的关键指标,可以帮助从事水文、气象和农业等领域的科学家更好地理解与水文相关的生态模型和过程。 版纳植物园恢复生态研究组博士研究生赵志猛在导师沈有信研究员的指导下,以云南省石林县世界地质公园的林地、灌木地和草地为研究对象,利用2014年至20
3.2-一种简单有效的降低-RNA-3'端异质性的转录方法
在 2 个 5'端的核苷酸进行核糖基 C2'-甲氧基修饰。用修饰过的引物 PCR 扩增得到的 DNA 仍可降低 N+l 活性,由于 PCR 可以产生几个 kb 的长模板,因此可以制备少异质性的 RNA实验材料8umol L 顶链8umol L 底链5'末端 2 个核苻酸进行甲氧基修饰试剂、试
单细胞western-blot解析乳腺癌发生过程的细胞异质性研究
乳腺癌起源于乳腺上皮细胞,原因是乳腺上皮细胞发生基因改变,导致随后组织稳态丧失。科学家们经过大量研究将乳腺上皮细胞分为几个不同的亚群,但依然无法完全了解上皮细胞异质性和分化谱。加州大学欧文分校(University of California, Irvine)的科学家,在最新一期Nature Com
揭示了磷硫酰化修饰在全基因组水平上的异质性
DNA是重要的遗传物质,储存着所有蛋白质和RNA的全部遗传信息。DNA上的任何一个微小的变化都有可能改变生命的遗传信息,影响生命活动,如经典的DNA甲基化修饰在生物界具有保护遗传稳定,调控DNA复制、转录以及翻译过程等重要功能。DNA磷硫酰化修饰是由邓子新发现的,DNA骨架上硫原子取代磷原子上
JIPTest检测丛枝菌根菌调节玉米PSII异质性免受高温胁迫...
JIP-Test检测丛枝菌根菌调节玉米PSII异质性免受高温胁迫的研究 基于生物膜中能量流动理论的快速叶绿素a荧光动力学OJIP曲线和JIP-test分析,具有无损、精确、快速的特点,如今已经广泛应用于植物逆境生理的研究。 OJIP曲线对各种环境的改变非常敏感,如光胁迫、化
iCIEFMS在线直联技术表征单克隆抗体的电荷异质性
前言 全柱成像毛细管等电聚焦(iCIEF)电泳已成为生物制药领域治疗性单克隆抗体(mAb)电荷异质性分析的一项重要技术,无需传统CIEF方法的迁移步骤即可通过紫外实时成像的方式完成蛋白分离和定量检测。除了电荷异构体的定量分析之外,通过在线电喷雾电离质谱(ESI-MS)的方式直接表征分离的电荷异
“基础科学学者奖”花落中国学者
近日,第45届美国圣安东尼奥乳腺癌大会在美召开,复旦大学附属肿瘤医院乳腺外科主任邵志敏教授、江一舟教授领衔开展的一项三阴性乳腺癌基础转化研究入选本次大会的主题报告,这是今年中国大陆地区唯一一个全体大会主题报告。 会上,复旦大学附属肿瘤医院乳腺外科教授喻三见为现场万余名学者做了题为《ZNF689